Introduce WrapLayout to replace FlowLayout

FlowLayout does not really flow components into separate lines when they
overrun their horizontal space. WrapLayout does this.

Also moved the contents of org.simantics.utils.ui.awt into
org.simantics.utils.ui.internal.awt since that code was never meant for
public use. Moved WrapLayout into org.simantics.utils.ui.awt and
published that package.

refs #6814

Change-Id: I65600f9a5edff021ab011d980bb3352f6141177f

Depend only on org.apache.poi/3.15.0.

refs #6813

Change-Id: Ibb75d457a908e43ee01a8579d3bd4c1414c6d20a

Use direct repository links instead of composite repository link.

There seems to be problems with Tycho and composite repositories and
furthermore, otherwise the composite repository would always have to be
bumped separately to get updates to clients.

refs #6813

Change-Id: I90f164f8df1048340b30fb6f2c33823323a0c632

Cleaned up external components list in target platform definition

refs #6813

Change-Id: Ia8bfa159767af3e088cc3ba38fbec7fa2e494e48

Added back dependencies of org.apache.poi 3.15.

Added org.apache.commons.codec, org.apache.commons.logging,
com.github.virtuald.curvesapi, org.apache.xmlbeans back to external
components to be used by org.apache.poi 3.15 which will be manually
bundled.

refs #6813

Change-Id: I9dbd405a0106a8b05e22d35bcf7a187584b86e57

Added org.apache.commons.collections4 as external component.

This change also removes org.apache.poi.{,ooxml,ooxml-schemas} from the
external components as preparation for including manually bundled
org.apache.poi bundle version 3.15.0. org.apache.commons.collections4
was added because it is a dependency of this new version of POI.

Due to org.apache.poi.{,ooxml,ooxml-schemas} containing split packages
it is just easier to bundle the POI JARs into a single bundle to keep
bundle class loading happy.

refs #6813

Change-Id: Iefd4b52c0fafc4a0e7b6b9ed2bf6bac0e38a113e

Adding org.simantics.acorn.feature

Adding to features/pom.xml - fixing tabs to spaces

refs #6726

Change-Id: Ifbb02b4b63d86dd8cfa35c3854d12f5bf4e86c57

Fixing wrong ID's for modelled tests

refs #6726

Change-Id: Ibf9cda50e406e1e84d8afb28760cbe06f6a03b9a

Merge commit 'b3da313'

Sync git svn branch with SVN repository r33392.

refs #6751

Sync git svn branch with SVN repository r33392.

refs #6751

Merge commit '5da68e7'

Sync git svn branch with SVN repository r33390.

refs #6809

Sync git svn branch with SVN repository r33390.

refs #6809

Merge commit 'd7afa23'

Conflicts:
bundles/org.simantics.db.layer0/src/org/simantics/db/layer0/adapter/impl/EntityInstances.java

Sync git svn branch with SVN repository r33389.

refs #6726

Sync git svn branch with SVN repository r33389.

refs #6726

Merge commit 'c46f0ff'

Sync git svn branch with SVN repository r33386.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Sync git svn branch with SVN repository r33386.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Merge commit '31664b6'

Sync git svn branch with SVN repository r33382.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Sync git svn branch with SVN repository r33382.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Use Layer0Utils.getDomainOf

The result can be cached by several uses.

refs #6800

Change-Id: I65c32408b1afdc1ca96de126e7ac86c46896b250

StructuralConnection added into Simantics/Structural

Also added getter structuralConnectionConnectionPoints

refs #6799

Change-Id: If9fe0b432437624b5fa082d042ffac9bd176ebca

Added property SEL.hidden that is tested in VariablePropertyRule

refs #6798

Change-Id: I0a23da64589abef202a3ac3ee9a5ee2210703b01

Fixed to remove duplicates

refs #6797

Change-Id: Ifb3bd95855c47b3cf424a1ec7ee5364b3aef4597

Search for dependencies in all available bundles.

refs #6796

Change-Id: I1e9c34ed5f617c7e872d95a22b45e136de5d643e

Merge commit 'd186091'

Sync git svn branch with SVN repository r33368.

refs #6459

Sync git svn branch with SVN repository r33368.

refs #6459

Merge commit 'a2a4242'

Sync git svn branch with SVN repository r33366.

refs #6793

Sync git svn branch with SVN repository r33366.

refs #6793

Merge commit '53059ca'

Conflicts:
bundles/org.simantics.scl.runtime/scl/Prelude.scl

refs #6726
refs #6788
refs #6791

Sync git svn branch with SVN repository r33364.

refs #6726
refs #6788
refs #6791

Merge commit 'e87f096'

refs #6786

Sync git svn branch with SVN repository r33359.

refs #6786

Merge commit '2a46c55'

refs #6502

Sync git svn branch with SVN repository r33358.

refs #6502

Merge commit '3efd7d44a55ae1fff284a1826e7c9afe27e0815e'

refs #6600
refs #6774
refs #6780

Sync git svn branch with SVN repository r33349.

refs #6600
refs #6774
refs #6780

Merge commit '0b471805f017da83d715a0d8409f53bdd009d31e'

refs #6654
refs #6766
refs #6769
refs #6770
refs #6771
refs #6772
refs #6773

Sync git svn branch with SVN repository r33345.

refs #6654
refs #6766
refs #6769
refs #6770
refs #6771
refs #6772
refs #6773

Merge "InputStream returns -1 on EOF instead of throwing IOException"

InputStream returns -1 on EOF instead of throwing IOException

ClusterSupport2.getValueStreamBig now returns -1 when EOF is reached.
Previously it was invalidly throwing IOException (and before that very
invalidly throwing IllegalStateException).

refs #6741

Change-Id: I220e6bd26b94d92ae1db5a330ca3304035e7614e

Merge commit '145a2884933f2ffdd48d6835729e58f1152d274e'

refs #6654
refs #6756

Sync git svn branch with SVN repository r33334.

refs #6654
refs #6756

Merge commit 'bd5bc6e45f700e755b61bd112631796631330ecb'

refs #6751 [PRIVATE-12404]
refs #6752 [PRIVATE-12401]

Sync git svn branch with SVN repository r33324.

refs #6751 [PRIVATE-12404]
refs #6752 [PRIVATE-12401]

Merge "Databoard and SCL enchancements."

Databoard and SCL enchancements.

Mapping for generic java.util.Map and java.util.Set references.
Moved databoard-related SCL definitions to a new Databoard module.
Added documentation string to Databoard.scl.
Added a few SCL bindings to potentially useful methods in the Binding
class.

refs #6738

Change-Id: I07369ca5a5ae23966b11ce5ff9787ab07e38af29

Merge commit '7684bae'

refs #6744 [PRIVATE-5991]
refs #6745
refs #6748

Sync git svn branch with SVN repository r33319.

refs #6744 [PRIVATE-5991]
refs #6745
refs #6748

Platform startup now reads the used database driver from <ws>/db.ini

Previously it was possible to use the wrong database driver for a
workspace if the default driver was changed in the code. Now,
SimanticsPlatform.setupDatabase will read the database driver used for
the opened workspace from an ini file <workspace>/db.ini. If the file
does not exist, it will write it with the following data:
[driver]
id = <database-id-value>

refs #6747

Change-Id: Ie304b480095657e25e694a81cdd5085a4d2c17e9

Fixed acorn db main.state loading rollback reporting.

The previous implementation caused main.state loading to always report
the database as requiring rollback which caused the system to always
delete all indexes on program startup.

refs #6709

Change-Id: Id3d90436c1960faa3ac5ebbc82e817b673934f53

Merge commit '0915910'

refs #6742
refs #6741

Sync git svn branch with SVN repository r33308.

refs #6742
refs #6741

Merge commit '55ca14c'

Sync git svn branch with SVN repository r33303.

refs #6740
refs #6726
refs #6739
refs #6735
refs #6731
refs #6730
refs #6729
refs #6728
refs #6724
refs #6701
refs #6669

Improve Databoard's dynamically typed data capabilities.

refs #6738

Change-Id: Iddbcf7e875aefa1bc70430b918cef3656ad97501

Merge commit '0580ea8b675c868685993b0780c9ecc31010f681' into master

refs #6726

Merge commit '3b5069d' into develop

refs #6726

Sync git svn branch with SVN repository r33290.

refs #6726

Logger fixes after merge commit:fdbe8762

refs #6724

Change-Id: I4559a65783b104aadbf8a5797aa6b3edbe128fea
(cherry picked from commit a0b1831418eba8870ca849ef2cd85823aa7bfa0a)

Logger fixes after merge commit:fdbe8762

refs #6724

Change-Id: I4559a65783b104aadbf8a5797aa6b3edbe128fea

Merge commit 'bf75fd9'

Resolved conflicts:
bundles/org.simantics.charts/src/org/simantics/charts/Charts.java

refs #6724
refs #6723
refs #6704
refs #6495

Sync git svn branch with SVN repository r33269.

refs #6724
refs #6723
refs #6704
refs #6495

Add Koloboke API and Koloboke Compile to target platform

refs #6725

Change-Id: I279092cc2136525bf6098502eeb75f4affd8bad9

merged svn r33251, contains graph.tg changes

Merge commit '9d2bb8d'

refs #6684

Sync git svn branch with SVN repository r33251.

refs #6684

Fixes for non-compiling code after merge 5930811a7

Merge commit 'ffdf837'

Resolved conflicts from:
bundles/org.simantics.db.procore/src/fi/vtt/simantics/procore/internal/GraphSessionVirtual.java
bundles/org.simantics.db.server/src/org/simantics/db/server/internal/SessionI.java
bundles/org.simantics.db/src/org/simantics/db/Database.java
bundles/org.simantics.db/src/org/simantics/db/service/ClusterSetsSupport.java
bundles/org.simantics.modeling/src/org/simantics/modeling/SCL.java
bundles/org.simantics.workbench/src/org/simantics/workbench/internal/SimanticsWorkbenchAdvisor.java
bundles/org.simantics/src/org/simantics/SimanticsPlatform.java

Sync git svn branch with SVN repository r33249.

Upgrade pdfbox to 2.0.3 and fastutil to 7.0.13 in target platform defs

Change-Id: Id16d9d58850a655efc5fbe779ea11233ab2d4fb8

Merge "Upgrade pdfbox to 2.0.3 and fastutil to 7.0.13."

Upgrade pdfbox to 2.0.3 and fastutil to 7.0.13.

Change-Id: I46b772c2a6c15347d33564f87ae2d52b095444e4

DB-client fixes

* XSupport.rollback for checking if database rolled back
* Separate read and write directory setting and updating in
ClusterSetsSupport

refs #6710

Change-Id: I3395c7042ab3faf2291ed215d4e5830d80b6d2fa

Work around one active experiment per model limitation for FMI studio.

refs #6711

Change-Id: I78a98ca08b81828a728f8bd0ab4c338a064a04fd

Fixing SpreadsheetBookRemover to not fail with URIless resources

refs #6568

Change-Id: Idcf961b7d21ad29fd94010013590e555eaba4c5b

Acorn: Fix WriteRunnable.runReally() and other fixes

Lets hope this crlf thing is over after this

refs #6709

Change-Id: I4e69d8eebf790c2bf4352c1bc8130ba62f126d2f

Merge commit 'd1a82fe'

Allow selection of modules to rename through checkboxes and Select All/Clear Selection buttons.

refs #6708
[PRIVATE-11320]

Allow selection of modules to rename through checkboxes and Select All/Clear Selection buttons.

refs #6708
[PRIVATE-11320]

Merge commit 'bb1507f'

Sync git svn branch with SVN repository r33219.

refs #6706
refs #6704
refs #6702
refs #6701

Utilize slf4j

Changed System.out/err prints to use logging in several places. Removed
org.simantics.Logging and replaced all uses by slf4j.

Change-Id: Ib0a9f4f87b945fd59130a9dfd02fe02d39ee0eac

Changing existing log4j logging to use slf4j

Removed org.simantics.utils.logging.{Logger,LogManager}. Anybody using
those should just switch to using slf4j. Removed their use from
org.simantics.spreadsheet.graph.

Also changed org.simantics.utils.FileUtils to use slf4j instead of
log4j.

Also added .keep to org.simantics.logback.configuration/src folder to
help it compile properly.

refs #6705

Change-Id: Ib6d78ee964e0a05aedb332167456aee4eea2a4d7
Signed-off-by: Tuukka Lehtonen <tuukka.lehtonen@semantum.fi>

Adding configuration logging for Simantics platform with SLF4J and
Logback

Adding logback.xml file to org.simantics.logback.configuration bundle
for configuring logback logging

refs #6705

Change-Id: I67abe04ed0d6a54b6a45fb3591bbb6b5a3991b2a

Changed database driver of TestSCLOsgi to acorn

Change-Id: Ie8d92025bb3976a210a8f4d36a0e2d74eea5eb09

Automatic execution of SCL tests in Maven

This includes both compiler tests (in
tests/org.simantics.scl.compiler.tests) and a test that checks that all
SCL modules in org.simantics.sdk feature compile (in
tests/org.simantics.scl.osgi.tests).

This commit contains also some modifications to make all SCL
modules compile:
* Disabled Data/Json, because it does not compile (missing jackson)
* Committed away Simantics/Image/linkImage

Change-Id: I22a460d756f65139971f1e7d2cc8624a7a6b8ffb

Merge "More Enhance logging for Simantics platform with SLF4J and Logback "

More Enhance logging for Simantics platform with SLF4J and Logback

Changing pom.xml to override generation of ch.qos.logback.classic

refs #6705

Change-Id: I512378d6a583b062c74bffc8c46b743eb2d68305

Enhance logging for Simantics platform with SLF4J and Logback

Fixing typo in feature.xml

refs #6705

Change-Id: I2984a5017265389ebede223111c8d78627117ada

Enhance logging for Simantics platform with SLF4J and Logback

Include the new logging bundles in org.simantics.rcp.feature.

refs #6705

Change-Id: I0711950cbb858a1bbcf0b3a14f648b98707dc1ca

Merge "Open module when pressing F3 on import or include declaration"

Merge "Rebuilt graph.tg with latest graph compiler version"

Rebuilt graph.tg with latest graph compiler version

refs #6692

Change-Id: I13172185137f8b6164efdf235d18d6e0d288f784

Open module when pressing F3 on import or include declaration

Change-Id: If53a968b8a29a7c6a18ae9f1e44bac06df13bbd4

Check that do block is not empty.

A new check is needed, because parser was modified before
to allow empty blocks.

Change-Id: I7fa51c7ef25cae6a51e69f9a39378780094c0d8e

Fixed target platform e4 tool location content.

Change-Id: Ic4a58eebb4cf864db0d4c4cc6cfee361c635a13a

Merge commit '12468c2'

Sync git svn branch with SVN repository r33219.

refs #5039

Merge commit 'a371783'

Sync git svn branch with SVN repository r33218.

refs #6692
refs #6568

Merge commit '8e4e41fa135641b23f68e205832e0696951c5f63'

Sync git svn branch with SVN repository r33216.

refs #6653
refs #6699
refs #6700