Allow simulation stop handling in Simantics/Sequences

`StopReason` enumerates supported reasons for simulation stops which is
delivered once to functions registered through `executeWhenStopped`.

It is up to the domain-specific sequence runners to implement the actual
identification of simulation stopping situations and to invoke
AbstractActionContext.stop(StopReason reason) when needed.

gitlab #385

Change-Id: I2bc354b3bf433909c5224f82c98c17b1ec564920

Prevent undesirable UI code access when workbench is not running

Also removed old and useless E3 ExperimentListener implementation

gitlab #384

Change-Id: I2ae3bd5efbc3ab92fc87aca0de8625dfe6a0e7a0
(cherry picked from commit f37ba060464d2230f86c6786572d33026800eedc)

Set resources immutable

gitlab #369

Change-Id: Id1ddcc8253339ac7ab60f2772ab53d5c06547b19

Separate query dependency management from QueryProcessor

gitlab #379

Change-Id: I23afbaef397f23b3645d47ac71906736b1021044

Merge changes I78c3a258,I7bf72f04

* changes:
  Handle componentless parent nodes of UCs in synchronization
  Added logging for history archive import failure cases

Handle componentless parent nodes of UCs in synchronization

gitlab #382

Change-Id: I78c3a258e5a33cb16ae38ef080424d382f42c710

Added logging for history archive import failure cases

gitlab #381

Change-Id: I7bf72f047a24932e3dbc4fd48781bad0f879a472

Merge "Add node class names to generated SVG"

Add node class names to generated SVG

gitlab #380

Change-Id: I721d774f8adf8864704409ec48c88f3a06fe15a3

Merge "Try to read queries from cache also in cases where cache is not written"

Bumped master version to 1.41.0

Merge "An action for experiment activation"

An action for experiment activation

gitlab #378

Change-Id: Ie52f085a94d71905044dc32debae3fc46732e8a1

Missing arguments in SCLFunctions.evaluate

gitlab #377

Change-Id: I4318bcea21696a69e3ae6ce4718090ac7737cf2b

Try to read queries from cache also in cases where cache is not written

gitlab #320

Change-Id: I4446238b8998f592df710b2992ba3c2cc6fe0bee

Merge "Include disconnected flag terminals for connection judgement"

Fix ObserverGroupListener equals

gitlab #375

Change-Id: Ib9155cabef7833f1433aa90c2754f82c3c2185f8

Support enumerated property types in UC interface (2nd try)

Other improvements:
-Support labels in enumeration values
-Sort enum values in edit combo alphanumerically (was hash order)

Bugs fixed:
-Instantiated values for IC properties were not converted properly on
type edit if the UC was defined in linked index root

gitlab #339

Change-Id: Ia452d0523a7a215181745870515cb74b8c838e90

Improved the positioning of issue decoration for connection elements

Shows the issue decorator at a point that belongs to the connection and
is closest to the center of its bounding box. Also fixed the updating of
position.

gitlab #372

Change-Id: Icf948997a9a2ce11a6420d83286144328af4e877

Pass model instead of null

Fixes yet another regression.

gitlab #355

Change-Id: Ic61cbbe347c8f66addf10397fa0f5969dacacad6

Pass graph to prevent transaction within transaction

Fixes regression from previous change.

gitlab #355

Change-Id: I40e8351373cf6b7f291402aded74ab73f624e70e

Pass graphs as ReadGraph instead of Object for clarity

gitlab #321

Change-Id: Id061b4d16f95a403a861e3cc06f1980c1a1dab60

Use PreferredDiagramEditorID in OpenDiagramEditorFromComponentAdapter

gitlab #371

Change-Id: Ia2b39d03f346a47c45b3982ec882b9facc9e28eb

Report non-existent .sts tests using error logger instead of NPE crash

gitlab #367

Change-Id: I55408e6b8b539bb3775e7ff5afc7f32323e32eb2

Fixed typical synchronization to work without template diagram desc

gitlab #370

Change-Id: I243d9baa3939234c9b31e1c8f34526b2c9fe641f

Log test name before and after execution with timeout and exec time

gitlab #367

Change-Id: I3ff6b1da4e773987bfc1d83fee9cef3f302a3d5e

Merge "Revert "Support enumerated property types in UC interface""

Revert "Support enumerated property types in UC interface"

This reverts commit a175b74181c4841b403170f03e1ad9caac946f53.

Reason for revert: The changes caused problems for String datatype users. The implementation needs further refinement.

Change-Id: Ie891a235fd21b44f178b7ccd40b04a5e9724a32d

Merge "Fixed typo from string returned from Rename.renameNode"

Fixed typo from string returned from Rename.renameNode

gitlab #367

Change-Id: I5524ae8c3133968a4819045fc2556439b5aa3526

Made orElseM associative

gitlab #368

Change-Id: Ideb97278b16455f0bf2d130547cf1c8713897686

Merge "Clean up also indexes during DB unit test environment initialization"

Clean up also indexes during DB unit test environment initialization

gitlab #367

Change-Id: Ia93e2e7169575f97b51ef27130b2579ef4d6fb4e

Merge "Selection view tab for managing issue validations"

Selection view tab for managing issue validations

gitlab #365

Change-Id: I273baaecb90bd88ec6f993593eb9315eb993479f

Merge "Improved constraint modelling utilities"

Improved constraint modelling utilities

gitlab #348

Change-Id: If1409441816c3d29b9f87829be965bda19f5280f

Improvements to SCL browse context contributions

gitlab #364

Change-Id: Iaa5d45e3c1a1023ca62110066947d4a822037991

Merge "Improvements to modelled SWT documents (fixed)"

Improvements to modelled SWT documents (fixed)

gitlab #357

Change-Id: Id366f13e6be8b598158e67af5d5a4aeb7644abb3

possibleObjectForType utility

gitlab #362

Change-Id: I3c88a860df44be625b8f63cbacdd906ea79264e9

Merge "Move contents of SCLMain in PlatformUI from pgraph to scl-file"

Move contents of SCLMain in PlatformUI from pgraph to scl-file

gitlab #361

Change-Id: I45fa44cc708a0292b0b68dfe2015cd4aef3e462a

Include disconnected flag terminals for connection judgement

gitlab #354

Change-Id: I318b0594d52fd4faf2d77e662e1ff04653922956

Use UTF-8 charset in SVG byte[] to String conversion

Suggestions for API cleanup listed in the issue description.

gitlab #358

Change-Id: I79c3a8f25f3ad679a5699bf43e689474fbe421f4

Support subrelations of DIA.Flag.ConnectionPoint in Diagram.setElements

gitlab #359

Change-Id: I070a1615057c7f17a55e43bdb975712201f3d710

Add index root resource initially to its own index

gitlab #360

Change-Id: I9c90b7ba36b818e3559741d72282ad057c58f774

Merge "Improvements to constraint-based issues"

Improvements to constraint-based issues

gitlab #355

Change-Id: Ia6ab17a6850e4ad1600e739063797a330077d5f6

Improvements to modelled SWT documents

gitlab #357

Change-Id: I281e90d871157775e1d9b789eb1a8886fb87bb17

Merge "VariableOrResource SCL type"

VariableOrResource SCL type

gitlab #351

Change-Id: I9106238d1bd2e8e07024a2bd21e0dd371ab8c091

Support enumerated property types in UC interface

Other improvements:
-Support labels in enumeration values
-Sort enum values in edit combo alphanumerically (was hash order)

Bugs fixed:
-Instantiated values for IC properties were not converted properly on
type edit if the UC was defined in linked index root

gitlab #339

Change-Id: I7d73a7465adb0ff13b3245ac332a37bff9095810

Small changes to synchronization base impl to allow extending it

gitlab #356

Change-Id: I66327777c16645c582573df0f485d2c5452e088e

Fixed Simantics/Diagram/setElements to resolve attachment relations

Resolution relies on using STR.HasAttachmentRelation information from
configuration connection relations.

For flags, it relies on flag type:
* Output = HasArrowConnector
* Input = HasPlainConnector

gitlab #352

Change-Id: I2a6f738f164141d688bd890f222ba9e8501aaeb2

Merge "Initialize new cache in flush instead of setting it null"

Initialize new cache in flush instead of setting it null

gitlab #353

Change-Id: Ib07b8c51c4adde6066ac4bf738bf067fec2249c9

Merge "Imported ModuleRepository.flush from Java"

Imported ModuleRepository.flush from Java

Change-Id: Ib0d147925995508c21d4acee7c4355feabd10f1f

Merge "Use trace level debug messages with ObjMap"

Merge "Name clash in structural ontology"

Use trace level debug messages with ObjMap

gitlab #342

Change-Id: Ice0dc7d7891ee672515ad8bf11ccd50d7c3a5758

Name clash in structural ontology

gitlab #350

Change-Id: Iaddf776424c58a3392078178e5cd9bf7c371f249

Fix to problems with outline view and SCL script editor.

gitlab #349

Change-Id: I93556f95471f63b8cc26d67d1e4daca48e32d062

Merge "Fix binding instance for CompoundRelatedGetValue method."

DB and Layer0 modifications for related issues

gitlab #347
gitlab #348

Change-Id: Ic5d2209d9865fc44583ea4814cc1d26d212a5f87

Fix binding instance for CompoundRelatedGetValue method.

gitlab #344

Change-Id: I899d10258c429e215c7c02f717e34631925ebc01

Fixed some issues in objmap2

gitlab #346

Change-Id: I37ca3edb171f5c88f9deac5f03ff29ecf8c28518

Support for linked lists in objmap2.

gitlab #345

Change-Id: I7107ac75961602e74ed44b2c3d9867aefe7d29d8

Use type reflection tools from databoard in objmap2.

gitlab #344

Change-Id: I489f462a0f1785bc52a7a7f94ff38f7cec612055

Merge changes I764df2ec,Ieb979991

* changes:
  Switch from org.apache.log4j to org.slf4j.
  Added missing creation of RelatedElementRuleFactory.

Switch from org.apache.log4j to org.slf4j.

gitlab #342

Change-Id: I764df2ecf1e58a1529c0a4e46653054ff15a2de7

Added missing creation of RelatedElementRuleFactory.

Also checks for missing rule factories.

gitlab #341

Change-Id: Ieb9799910c3c32a7c49dfd9be496bb9afbca0ab5

Merge "Defined L0.ValueType to make L0.Value(s) searchable from index"

Added anchors for SCL data types and classes in HTML documentation

* data Foo anchor: `data-Foo`
* class Bar anchor: `class-Bar`

Also changed data types, classes and values to have different background
coloring in the SCL HTML documentation for better readability.

gitlab #337

Change-Id: I731489cbb1a972dd6e2bc95645b66f41877e843d

Defined L0.ValueType to make L0.Value(s) searchable from index

gitlab #338

Change-Id: I2ceff6adbcd4d2967803e256c2988b3e85c6b77c

ListUtils.create(g,elements) creates a list without element inverses

Added new ListUtils.createWithInverses for lists with default element
inverse relations.

gitlab #336

Change-Id: I246d5bb170ff91d8f59aa656d6b0279f9b2b11b1
(cherry picked from commit d17ee3b8f3720f59c08780ced525d670a83844b0)

Fixed combo box list to open properly when starting edit

This order seems to work better than the old one.

gitlab #335

Change-Id: I22ed0fb0c41695b39ee88e6a9b6bc8bce16d6d0d

Fixed regression in enumeration value function definition

Due to this bug editing enumeration values opened text editor instead of
combo box.

gitlab #334

Change-Id: Ibfb62068ebc15ed56bc7a42f8921cf907eb6a75e

Use the same implementation to claim assertions in SCL and in Java

SCL version of claimAssertion did not claim L0.InstanceOf L0.Assertion.

gitlab #332

Change-Id: Ia61ba82435429a190e444d14e57c8e7782d206dc

First step to enable reading of cache when not writing

gitlab #320

Change-Id: If12e55796207f0d08f46fc0670760c2937593e89

Merge "Revert "First step to enable reading of cache when not writing""

Revert "First step to enable reading of cache when not writing"

This reverts commit cb12888f3415720276da57f2d162e13ea5b3f46c.

It causes an unexpected NPE during user component symbol
terminal population.

gitlab #320

Change-Id: I1adf19fadde29ad4127377606580aba4444f1eac

Merge "Define actions already in L0"

Merge "First step to enable reading of cache when not writing"

API for creating a new File Document

gitlab #326

Change-Id: Ic22fcdc5600883eeb1469112f267a8f2c4df4e90

Define actions already in L0

gitlab #327

Change-Id: Ia8ac62b8b6de90cc3e0b8e127a15d113f640270b

First step to enable reading of cache when not writing

gitlab #320

Change-Id: I3abe07cdce6c75d46dd1c537effe639734de627b

Support PreferredDiagramEditorID in OpenDiagramEditorFromConfiguration

gitlab #325

Change-Id: I95c7c075c3562410f5ba06c8785447f0cc53a860

Fixed filtering of connection points when any drilling is done

gitlab #324

Change-Id: Iad676ddea1ab4625f6bdc615dc83605707107260

Don't abort typical sync on blocked template to instance connections

Currently typical synchronization has a validation step that aborts the
whole diagram synchronization if there is even a single connection
missing from the instance diagram that cannot be copied from the typical
template because another instance-specific connection has been made to
the same functional terminal where the template connection is supposed
to be connected.

This changes the synchronization to simply report these cases as
WARNINGS in the verbose synchronization log and continue the
synchronization.

gitlab #323

Change-Id: I7661f6f069666fb0e6f724e6d0006e6632f93567

Revert removal of org.simantics.db.server inclusion

gitlab #109

Change-Id: Ic61826b9a210fa2733cc5b11a9474cebff2f4e82

Removed deprecated ProCore matter to make the platform less heavy

Removed:
* deprecated org.simantics.db.build.zip and related code.
* windows and linux procore executables from org.simantics.db.server
* org.simantics.db.procore.server.environment

In total almost 25MiB removed from the platform.

gitlab #109

Change-Id: I0b7532b0948676f925e0d0f619aadc5e06ea7ea1

Merge "Move debugging options under DevelopmentKeys"

Merge "Improve utilities for invoking SCL from Java"

Improve utilities for invoking SCL from Java

gitlab #321

Change-Id: Ia4130c541ac1515911c90483b528ad437bced6ae

Fix issue with updates of SCL module outline views.

gitlab #317

Change-Id: Ia749729d4410f6deee9176d01f572768f959b88e

Move debugging options under DevelopmentKeys

gitlab #319

Change-Id: Iabeb7d88912781768d4ee13dd8ecb531d7a82215

Add default property page to StandardModelledView.

gitlab #318

Change-Id: I57e8bea646c4c4aa24bf16df7b2c298c764f4eed

Fixing several binding-related bugs

* @Optional annotation added duplicate annotations to BindingRequest for
certain classes
* @Identifier annotation was not actually removed from the
BindingRequest
* BindingRequest hashCode calculation used annotation args excluding the
ones possibly found from the clazz.getAnnotations()
* Prevent replacing existing bindings in BindingRepository.classMap

gitlab #313

Change-Id: I774649584c288c197f1f8ca6af78682b296b63d4