Merge "Tons of dependency fixes and updates"

Tons of dependency fixes and updates

* Removed unused JARs from org.simantics.scenegraph and re-exported
  org.apache.batik from there instead of including three old batik JARs
  internally to export the batik parser.
* Replaced all dependencies on org.apache.commons.collections with
  org.apache.commons.collections4
* Removed version specifiers from all org.slf4j.api and
  org.eclipse.collections.eclipse-collections* dependencies
  to avoid the need to modify them down the road with new major releases
* Explicitly specified all Jetty dependencies to be on version 9.4.24
  in an attempt to avoid OSGi (Felix) bundle wiring performance problems
  experienced by Marko in recent developments.

gitlab #485
gitlab #486

Change-Id: Id5a3d62a007fad4a45f601b4d471f061395e556b

Export jersey internal packages for jersey-media-multipart

gitlab #486

Change-Id: I4fb177fa365babfab7950a920784328f2976569d

Update rest of external components & explicitly export javax.ws.rs*

gitlab #486

Change-Id: I858750bb69a0ebade617c72f29ee76330394954e

Update rest of external components

gitlab #486

Change-Id: I7f3bed6a5d6271fa94f1f1e7e6f3619fa7c85d02

Updating external component versions & add influxdb-client

gitlab #486

Change-Id: I4348db51b082aedaf26bd8c9458f1b81cef0f512

Thread safety changes in objmap2

gitlab #483

Change-Id: I3a831732961ff7fc3ac6db3a2fdb94c2e9361d7a

Eliminate unnecessary storage of graph objects in map objects.

gitlab #482

Change-Id: Id600bda6892857a376cd169219636dc0300763d4

Flush listener registrations before garbage collecting queries/listeners

gitlab #481

Change-Id: I5aa5c3ef420faebba4a2c347cd999035bada675f

Finish exception handling in AdapterRegistry2

gitlab #480

Change-Id: I339986806570a4373456e4fb92a7b7712f531f7b
(cherry picked from commit 8eea274269dd791b7ef95ca03bf891654e0c4ffc)

Separate TextNode handling for SCLSceneGraph

gitlab #476

Change-Id: Ib50bf50f7b6b39573fceae8ff1cc87f7ef203885
(cherry picked from commit fc7afa94bb7704fedf0dd2f3da7923d6aa732ea3)

Merge "Add line bounds to highlight bounds to get actual bounds."

Merge "Temporarily added debug logging to MipMapBufferedImage for debugging"

Temporarily added debug logging to MipMapBufferedImage for debugging

gitlab #477

Change-Id: I553d4f7ed99c0b48cf1fe386669ae46d6ca68de2

Add line bounds to highlight bounds to get actual bounds.

This fixes text clipping with italic font

gitlab #475

Change-Id: I7223d6b7e960f28c61644ba7bc608b46530a58a1
(cherry picked from commit 5d435de8ba4147560a795f8873d234a0489050b2)

Remove single quotes from font-family value

gitlab #474

Change-Id: Ic63ff4a33739835f809e9a87dc8f31a3d375346d
(cherry picked from commit 738c0625bf766316b39aa7c9884a47d3711d548c)

Stop using pack200 because it has been deprecated and removed

Deprecated in Java 11 https://openjdk.java.net/jeps/336 and removed
in Java 14 https://openjdk.java.net/jeps/367.

The main problem for us now is that the packed JARs don't get
signed when using maven-jarsigner-plugin, while the unpacked
ones do. Simplest solution is to let go of pack200 already.

gitlab #468

Change-Id: I2f6769802cfa51f9d2fd410a125831849f7d484f

Whitespace support in directory names for publish.sh

gitlab #468

Change-Id: I875cf2537633b9d987020935941946df2dd117fb

Regenerate P2 repository metadata after signing

Otherwise te checksums in artifacts.xml will be invalid builds are doomed.

gitlab #468

Change-Id: I4eddd4d0a9ef19e37bfc9a26a5e5c94c486e0bda

Fixed signing problems with directories containing whitespace

gitlab #468

Change-Id: Iec62b603024dd362a9e69676bb5fdf0617d1b966

Support signing of platform external dependencies and SDK

Swiched to Tycho 1.5.0 and removed broken category.xml files
that broke the build with Tycho 1.5.0 compared to 1.0.0.

gitlab #468

Change-Id: Idab1eb2d4ce2b2e5b7b4cccc1fd5d18217e5e83a

Simantics integration STS

gitlab #472

Change-Id: Ic65e158b277f7a1a9b4ce788f95f4dec5ab89ac4

Allow customizing TextElement default vertical alignment

gitlab #471

Change-Id: I05ead92b16fe172672231bbc9a2ac0f7da5b9da6
(cherry picked from commit e14a9fd13c79c0c3ca1d5af56727d80f8940f437)

Use slf4j logging in ModelledView

gitlab #473

Change-Id: I6b0bbbb4a8fe375ee0ad434d3e8f42c1c235f3e8

Improved shared library structure dump to take more types into account

Added support for:
* L0.SCLScript
* GF.File

This also removes dumping of the .pgraph file from the shared library
exporter because the contents of the generated .pgraph file have never
been complete, nor stable enough to actually give out any information on
what has changed and how. The system gives no diffs out on what most
usually changes, i.e. SCL modules, scripts, SVG files and other similar
textual data.

gitlab #452

Change-Id: Id35b8b6d339398ba89aca3e10aff7aeb4c610242

Merge "Fixed Path2D creation to work with overlapping RoutePoints"

Added alternative constructor for inputting text scaling factor

gitlab #471

Change-Id: Ie1a394e41f4807bc99e0de3cef891730fa27be8e
(cherry picked from commit 01d6a043fc7513dd93853f4fc2a7b326aee1f832)

Support for creating shared ontology dump to git

More generic implementation

gitlab #452

Change-Id: Icaeb7d33386b037f48c5154b1fe8777b04f3b38d

Fixed Path2D creation to work with overlapping RoutePoints

gitlab #470

Change-Id: I678361037ec23258c3c1710a475dc25b2971ab4c

Merge "Templates for creating SCL values"

Templates for creating SCL values

gitlab #469

Change-Id: Ie3b684e106cba76cb70f238c885ef42487de0cfe

Added createElementClassProvider method for override purposes

gitlab #467

Change-Id: Ia66b5833ff22cfa583b134470053e365d0c2547f
(cherry picked from commit d2fa2fcfc15f056eaa5468601e886529abc4ae18)

Mapped dev-wiki conversion situation for situational awareness

gitlab #99

Change-Id: I3fcecb0db279494bebf3916d7c75eab30cede9dc

Continuing markdown conversion

gitlab #99

Change-Id: I81129bbba840369a43bdce0bcfee09a3836c51b8

Merge "Make it possible to debug SCL compiler in production builds"

Rename and move 'modeling.adapters.Removers' and make it API

gitlab #466

Change-Id: I0e86bf7ebce158de3e1627059909040960c6ba08

Make it possible to debug SCL compiler in production builds

gitlab #465

Change-Id: Ie032c198f9e9aa9d21a41c0b223c6534a2b070f5

Merge "Use NIO file API instead of File"

Use NIO file API instead of File

gitlab #462

Change-Id: I1472003a00b42cecb8fe9423707aa8ec8b4717e6

Merge "Non-constant external value configuration via procedural UCs."

Merge "Easier baselines"

More sequence terminal relations

gitlab #463

Change-Id: I0a59b80bbe26ac67b6b642219e4750ad63417ba2

Easier baselines

gitlab #462

Change-Id: Id79b6070fded8224045f2f044e3dc70c6059363e

Getting Resource from ISymbolItem

gitlab #460

Change-Id: Ic2eeaf432b974da2094d72794267387dcf7e9562

Non-constant external value configuration via procedural UCs.

gitlab #461

Change-Id: I764644ea60a421e6c807486c925ccd9e33aa6928

SCL bindings for symbol library

gitlab #460

Change-Id: I09011413b93b66e10782dfc788429d14fcdb3b33

Merge changes I3a38eed6,I3f8b3504

* changes:
  Wrong graph was used when performing async query from session
  DB request scheduling scheme fails with district diagrams

Wrong graph was used when performing async query from session

gitlab #457

Change-Id: I3a38eed6b63eb2559893c831b05a9d512bf34745

Expose Batik SVG/Path handling APIs

gitlab #458

Change-Id: I2ad25ef0aa4cb62d676ab9cfcff42ec0989b9cef

Support for random shaped terminals

This commit includes changes to support awt Path2D based terminals
(currently external implementation).

gitlab #456

Change-Id: Id266bba00fc8dd84e62157280143a0f18c0921e0

DB request scheduling scheme fails with district diagrams

gitlab #457

Change-Id: I3f8b3504cd4b26f670fd45c79ab4e192fb0091d8

Merge "Multiple readers in db client"

Multiple readers in db client

gitlab #5

Change-Id: I5a44b7d19f6529f1ceceab1875e227db326e1c24

Ordering of connections was not stable

gitlab #452

Change-Id: I05041db794780e153ab19a01187cd8ca392fdb77

Merge "Support for creating shared ontology dump to git"

Grant access to diagram APIs to enable web based diagram editing

gitlab #455

Change-Id: Iacbfc3eece3c49712cdfa240395d8b2df58c51b4

Support for creating shared ontology dump to git

File name escaping from FileUtils

gitlab #452

Change-Id: I1e2d55f04f916a0fd0938fc27cb72ca56fa30000

Merge "Optimise performance of job scheduling in QueryListening"

Optimise performance of job scheduling in QueryListening

Reino was correct - this synchronization was indeed broken.

gitlab #450

Change-Id: I65280947385963d52073df78f604d98741beb12f

Allow PickSorter access to the PickRequest used for pick operation

New default-method on the PickSorter interface keeps the API/ABI
backwards compatible.

gitlab #454

Change-Id: Icef2d4b5349bbbbfb275d9c1e6a2ecaac8d610b7

Merge "compile method in CompileProceduralComponentTypeRequest"

compile method in CompileProceduralComponentTypeRequest

gitlab #451

Change-Id: Ied7ad06acb2cc68c3f325d3dbb8614d3023d0e90

Bumped master version to 1.43.0

Stop using SWT.MOZILLA

Fixed also logger-related deprecation warnings from VariableDebugger.

gitlab #449

Change-Id: I44eaf65389a14b4ac4f7d3efde288d5d67b4c725

Fixed string externalizations for AssignSymbolGroupDialog

gitlab #330

Change-Id: Ia0f39351dfd8bbc68510965cd364e9843e7bfb6b

Trace level logging for compilation status in SCLOsgi.compileAllModules

gitlab #448

Change-Id: Ie23faa3474f42e8361e64ed0f84ad24c2ce18aee

Improved environment resolution for document SCL expressions

gitlab #447

Change-Id: I4d84204eb6c2371b60c648b04e81b0cd36765f4e

Added feature for batik for easier target debbugging with the IDE

gitlab #198

Change-Id: Ia8d101e7d06a686350e939b29097e63b7570db57

Bumped target sequence number after e20a07f4

gitlab #198

Change-Id: Ic0e8faf9d9af160b9d7785f71644e34779a55a90

Updated Batik from 1.8.0 to 1.12.0

gitlab #198

Change-Id: I6e822c407a387fc3762366d8f2d3fdc9aa00037a

Switch to aries spifly 1.2.3

gitlab #405

Change-Id: I51289aa93a2705364fd654df1bd35b6d6d4242ae

Switch to aries spyfly 1.2.3 from 1.0.14

gitlab #405

Change-Id: I444675c407ce69a8005cd57e613a1f76aa79cc89

Upgraded eclipsec.exe launcher to Eclipse 4.14 version

gitlab #405

Change-Id: I2bee36439d3ead76adb49b4233858f36fd86e9dc

Fixing platform to build on the Eclipse 4.14 target

* Added org.eclipse.jetty.server 9.4.5
* 32-bit Eclipse is no more, so removed all 32-bit bundles and
  related definitions

gitlab #405

Change-Id: I580375d93b105edd01097d326567948918b7bdc9

Moving to Eclipse 4.14 based target platform

gitlab #405

Change-Id: I4049beafdaa118b94928fdcbaeccb60a9f5c672c

Changes for Eclipse 2019-12 RCP platform compatibility.

* org.eclipse.equinox.util seems to have been removed, removed
  unnecessary dependencies to it
* Expand org.objectweb.asm* required version range to [5,8) from [5,6)
* Removed dependency on org.objectweb.asm.xml which no longer exists as
  a separate bundle.

gitlab #405

Change-Id: Idcb6fee939da8cda9d44f230fb6e6118bc9e5e6e

Removed org.simantics.db.procore.ui as it is not used anymore

org.simantics.db.procore.ui essentially contained ProCoreUserAgent which
is no longer invoked in any case because procore is no longer an
alternative.

This is also related to #405 because the UI class contained
MessageDialog use that was no longer allowed in Eclipse 4.13 and
onwards.

gitlab #446
gitlab #405

Change-Id: I8e61394d1410f4396424e006c4b09dbd8f413cf1

Switched from Eclipse 4.13 (2019-09) to 4.14 (2019-12).

gitlab #405

Change-Id: If09c23c206d8591fd07bfae5bdab5ab536b26f30

Add javax.inject dependency for 4.13 support

After eclipse 4.13 org.eclipse.core.runtime no longer re-exports
javax.inject, which means annotations like javax.inject.Inject and
javax.inject.Named must be imported by importing the javax.inject
package explicitly in bundles that use it.

This change also works with the old 4.7 Eclipse.

gitlab #405

Change-Id: I752e97570ea4917633dd655e1c6b59d98751db87

Fixed argument passing in async/sync read/write SCL functions

These arguments haven't really been used in SCL code invoking syncRead,
syncWrite, asyncRead or asyncWrite which is why these have gone
unnoticed for quite long.

gitlab #321

Change-Id: Ia879115e3a9c73059691f53b5bdbac64afb9d4ab

SCLFunctions.syncWrite does not check if graph is WriteGraph

gitlab #425

Change-Id: Icb771e425c170e00385b943a6a6dde2cf62e2d9b
(cherry picked from commit 579f8512543a88945e94ce619a4a20c307e67f4f)

Merge "Sort symbol item contributions alphanumerically, not lexicographically"

Sort symbol item contributions alphanumerically, not lexicographically

gitlab #445

Change-Id: I5efebb587654644a1f7cac85bdc03aea209dff2f

Support ontology install option trueWhenDeployed also during development

gitlab #444

Change-Id: I038de840b1b76b3638338542d23baae2ba2a903f

Merge "Implement equals/hashCode for PropertyInfo"

Expose TransferableGraphImportProcess Resources table.

This allows us to process the Resources with ImportAdvisor.beforeWrite()

gitlab #433

Change-Id: I4537549167e4816bb888b5891aea7e98d84b9184
(cherry picked from commit 680b5fe108fc6929d40785c76ec7444bbb092f51)

Merge "TransferableGraph import to VG with different name"

TransferableGraph import to VG with different name

* Root are processed first during tg import, which allows Import Advisor
to replace the current name.

gitlab #432

Change-Id: Ia297b4df4c0ad1895a985f592064a178a6c4fb10
(cherry picked from commit c85fa803ee6833f46532097250ba0c3ac5ace86c)

Upgrade to Nattable release 1.6.0 from 1.5.0

gitlab #443

Change-Id: I840a9e60e35a668631feb48aae2e8f30b5b73326

Implement equals/hashCode for PropertyInfo

Take immutability into account.

gitlab #442

Change-Id: I0c2fe55c691537e91af6449ec544a4eec824092f

Implement equals/hashCode for PropertyInfo

gitlab #442

Change-Id: I6f6d2fc1f7266dbdd7bacf24751d9ab6b9dd94ac

Make StandardVariableBuilder singleton

gitlab #441

Change-Id: I28bb5ccb8f5164e3bbe4f0e0c68d4b221cb35d24

MainProgram polls nanoTime too often

gitlab #440

Change-Id: I9d6b1514907682b990ae21588ced70b35f5ed6f5

BrowseContext creation fails when including invalid contributions

gitlab #439

Change-Id: Ie985db8ac57c43c081a77df390c48e7b32c1042f

Added new field TypeId to dependency index for exact type searching

The new field is String-valued and contains a concatenation of the
resource ids of a resource's type hierarchy, separated by a whitespace,
for example `41233 12423 1233`. This field uses the WhitespaceAnalyzer,
i.e. its contents are tokenized by whitespace and thus searches like
`TypeId:41233` will return exactly those resources that are instances of
the type resource `41233`.

This commit also simplifies and fixes some of the existing index
searching code to use this new field instead of the old `Types` field
for type-based searching.

If existing product-code uses the indexing facilities directly and not
through `QueryIndexUtils` or `Instances`, such code will also require
changes to take this new field into use.

See `IndexQueries` to form queries related to this field.

gitlab #438

Change-Id: I9992ad32a9e6da41c88641e60fed6e1793253738

Fixed Simantics Console activation and formatted message output

Also fixed an NPE from org.simantics.platform.ui.internal.Activator.stop

gitlab #437

Change-Id: I83e5d08d49ee0f97ac6c81987054ffa01b916516

Limit SCL Console buffer size to 5M characters by default

Low watermark limit for the buffer size can be configured from the new
SCL / Console preference page. High watermark is always set to 100 80
character rows larger than the low watermark.

Buffer size limiting can also be disabled/enabled entirely from the same
preference page.

gitlab #104

Change-Id: I8be203e60ae49fce53c39a4d251d2575a64b2543

Fixed SCLConsoleView.setCurrentImports to be performed in a Job

The job is marked as a user job so if it starts taking time or gets
blocked due to DB, it should get shown to the user as an ongoing job.

gitlab #164

Change-Id: If2dc1389ceb4b3f868f27b17c59b0e59233b9734

Merge "Catch Throwable instead of Exception in SCL AsyncUtils"

Prevent NPE in JsonUtils.readPossibleVariableUri

Previously NPE could come if the input JSON contained e.g. array values.

gitlab #331

Change-Id: I0b4c5134de12685414716ff9cef479d48cabd8ba