ReflectionAdapter2 does not handle all Throwables

ReflectionAdapter2.adapt() does not catch all throwables (e.g.
NoClassDefFoundError) enabling the possibility that the throwable is not
shown to the developer in any manner (console or log)

refs #6898

Change-Id: I32388ebcb23233210c2e54f8530f7e8c626f28de

Merge "Ensure GetElementClassRequest is not constructed without elementFactory"

Merge "Remove unused import in DeleteHandler"

Merge "List the unsatisfied dependencies in CanvasContext"

Merge "Adding more detailed message to thrown exceptions in SyncElementFactory"

Remove unused import in DeleteHandler

refs #6898

Change-Id: I555641ab201e50e35a17e6e3d3b68d97638f701d

List the unsatisfied dependencies in CanvasContext

refs #6898

Change-Id: I07de49394e871d27f6df172c02cfdff05cde44b1

Ensure GetElementClassRequest is not constructed without elementFactory

refs #6898

Change-Id: I905188f352bbaeae7787d817e7b0835a36138abf

Adding more detailed message to thrown exceptions in SyncElementFactory

refs #6898

Change-Id: I7d9c2b175f25d06b84fbda8938875bb8ab824f81

Improvements to SCL compiler error messages

Better error message if type annotation has different number of
parameters than the function definition.

Refactored method names, we have now getSyntacticFunctionArity for
estimating function arity without type information and
getFunctionDefinitionPatternArity for arity calculations of patterns.

refs #6897

Change-Id: I032ee0e5da416f232517d1e03c7a7cb0208c4d45

Reverted if-without-else feature in SCL

Removed possibility to have if-then -construct without else, because the
implementation changed parsing rules and some existing code was broken.
The feature might be added in future, if better implementation is found.

refs #6894
related to change (refs #6888)

Change-Id: I1c729c4176cfaf867ba3dbf13fd73fbc14f41e61

Fixing a deadlock. Some improvements to ModuleSourceRepository API

refs #6851

Change-Id: I4328ab825ae1bb9f9ab529c947f6b02a8d90be83

Set default database driver to acorn.

This change was made possible by change
I844171225284cb7a9d28b6ab5f00c4db88e2afa0.

refs #6887

Change-Id: Ib61f88b8759be4aec1f65887ca17847dc4e5201f

Merge "Re-enabled Acorn transaction cancellation support for testing"

Re-enabled Acorn transaction cancellation support for testing

refs #6887

Change-Id: I844171225284cb7a9d28b6ab5f00c4db88e2afa0

Removed unnecessary external jar procyon-decompiler

Change-Id: I84d92daf56f5dbbec67d412c4548b3a98462e939

Merge changes Ib86a41bb,I4fed12d3

* changes:
  Show modelled STS tests in model browser in execution order
  Run modelled STS tests in alphanumeric order

Merged changes from feature/scl to master.

This commit contains lots of SCL compiler and runtime changes:
* New CHR-rule based sublanguage. This change alters meaning of
when-keyword and so some code using when may break.
* Removed type classes Eq and Hashable. Compiler now generates and uses
Java methods equals and hashCode. This change is needed for better
interoperability with Java code.
* Type based overloading for symbols imported from different modules
* Some expressions ignore their return value (statements in
do/let/where, if and match cases if the return value of if/match is
ignored). These expressions can have any type and if/match expression
branches may have different types. Also if-expressions may have only
else branch. If the return value of apply-experssion is ignored, the
expression cannot be partial application that does not have
side-effects.
* View pattern support
(https://ghc.haskell.org/trac/ghc/wiki/ViewPatterns)
* Lambda-match support
(https://ghc.haskell.org/trac/ghc/wiki/LambdasVsPatternMatching)
* String interpolation can be used also in patterns
* SCL compiler regression test suite has been moved to a new bundle
org.simantics.scl.compiler.tests
* Improvements to SCL module editor syntax coloring
* SCL compiler refactorings, for example all name constants are now in a
dedicated class Names and CompilationContext merging old context classes
* Improved byte code for comparisons
* Improved code generation from string interpolation
* Anonymous object support in SCL backend (not yet frontend support)
* Bugfixes and new regression tests

refs #6888

Change-Id: I9d4c001d0323069d3b86a83369fa3581f02ee305

Show modelled STS tests in model browser in execution order

refs #6890
Change-Id: Ib86a41bb738cf9fab476ce062811deeeccc3f317

Run modelled STS tests in alphanumeric order

Run modelled STS tests in alphanumeric order in case of equal execution
priority

refs #6889
Change-Id: I4fed12d34de943ea9f950d209754c9465b2ce9b4

Added info on backup location to documentation backup.

refs #6848
refs #6881

Merge "Bump master versions from 1.25.0 to 1.26.0."

Import/export menuitems missing from Simantics Desktop product

Import/export were moved to separate feature
(org.simantics.modeling.ui.workbench.feature) in #6856, but this feature
was not included to Simantics Desktop product.

refs #6885
Change-Id: Ibfecb1974c15387298661842f133ecb7f5984355

Fixing modelled STS tests to not include nested JUnit suites

refs #6884

Change-Id: Ia86e62bae10e6ef12922e168231917bda40fc002

Fixing modelled STS tests to not include nested JUnit suites

refs #6884

Change-Id: I314f591d33bb06504f875b14041f12edc4dedb71

Added release schedule and produced artifact documentation

Also removed the -semantum.target file since
it is not really useful anymore.

refs #6881

Bump master versions from 1.25.0 to 1.26.0.

refs #6879

Change-Id: I3bdfa773562033d3dcc1d72a359cf61d7f35dfee

Fix desktop product configuration

Removed -Djava.net.preferIPv4Stack=true which is totally out of date. It
was an early day procore hack.

Added -Djava.util.Arrays.useLegacyMergeSort=true because the G2D scene
graph comparator for some still unknown reason runs into problems with
Java's TimSort implementation.

refs #6621

Change-Id: If931e8bfe60525015166813ac479f0aadeac8f90

Fixed documentation dumping scripts.

Dumped documentation is not stored in the repository, it would just bloat it.

refs #6848

Fixed release engineering target platform preparation instructions

refs #6621
refs #6848

Change-Id: I4d4b0b62ac1e87a841c6f9807d60ed3998fd2ede

Include SDK source in simantics.target

refs #6621

Change-Id: Ic8748eaeff962c5a21e660791c6c034c561b81f1

Include source features in generated SDK P2 repository

The problem was that the generated org.simantics.sdk.source feature was
missing from org.simantics.sdk.repository/category.xml and thus the
build would not include any sources.

Also bumped used tycho version to 0.26.0 from 0.25.0.

refs #6621

Change-Id: I10e63a77b414f67bb32168d93d0c612ac1bc0b56

Initial draft of Simantics release engineering instructions

refs #6621
refs #6848

Change-Id: Id726c100944fd4f1df7c54d9a2eed16a2ca88e6c

Target platform release work for 1.25.0.

Removed useless releng/org.simantics.target.
Moved releng/org.simantics.target/simantics.target to
org.simantics.sdk.build.targetdefinition/simantics.target and changed
its contents to match what shall be published on the web as
http://www.simantics.org/download/<refspec>/simantics.target.

refs #6621

Change-Id: I8e430cc9a724dd992f88abe8328606672f0de29f

Merge "Set tycho-packaging-plugin qualifier format to 'v'yyyyMMdd-HHmmss"

Set tycho-packaging-plugin qualifier format to 'v'yyyyMMdd-HHmmss

refs #6621

Change-Id: I0ebfcf451f2f7a909bb888d62e772f223a205379

Document server should use variable value request with binding

refs #6876

Change-Id: I772b301b7b66f60e2834d01e9a1a7b1d300adb26

Add VariableValueWithBinding request into db.layer0

refs #6875

Change-Id: If71e9d082473bfcf54314e376a39d610df05c987

An attempt to resolve this issue for good

refs #6169

Change-Id: Ia06d08568fa37b9a575f924dc35be5fe3fa1a941

Merge "ValueConversion.parsePrimitive consumes NumberFormatException silently"

Merge "Moved File menu Export and Import contributions to separate feature. "

Moved File menu Export and Import contributions to separate feature.

The contributions were previously in org.simantics.desktop.ui. It was
deemed best to move them to a separate plug-in and feature
(org.simantics.modeling.ui.workbench) to make it possible to prevent
forcefully including the contributions in all Simantics products.

refs #6856

Change-Id: If8a55a68113ff500fc1baccc317c172bc2d60a48

Support for console discovery

refs #6864

Change-Id: I9a7b7bceffab1bd1a501d32c295c6da81c52aafc

ValueConversion.parsePrimitive consumes NumberFormatException silently

Don't catch the exception since we want to be aware of the problem at
top level.

refs #6863

Change-Id: I4b09a0e705b2e6fdd62c3b59bc70e5c188abb59f

Fixed labels for search results restored from previous search memento

Also made the details label shown at the bottom of the dialog for the
selected entry a bit more legible. The URI that was previously shown is
now a root relative unescaped path for results contained by a model
root.

refs #6855

Change-Id: Iccd0762707d938009ea046f4ac8ef20571e353a1

Removed obsolete structural browser.

The current browser id is org.simantics.modeling.ui.browser and it is
contributed by org.simantics.desktop.ui.

refs #6857

Change-Id: Ib04f6c8be83409c8fc44c7267839cb1adca8c388

Re-enabled CTRL+SHIFT+R resource search dialog in org.simantics.debug.ui

This fixes the old problem where the index searches were not limited to
e.g. a 1000 hits but to Integer.MAX_VALUE instead. If the user happened
to write 'a' into the search field, this would return pretty much every
indexed resource and kill the JVM eventually.

This also fixes a problem from
org.simantics.modeling.ui.diagramEditor.DiagramViewer which did not
check diagram resource immutability before attempting to write a diagram
page description to it because it was missing. This can happen if you
use the resource search dialog to open e.g. diagram symbols from the
ontologies.

refs #6855

Change-Id: Id341871847e0ea8bdbc036e8023821ab0556a3cb

Added ResourceWorkbenchSelectionElement

refs #6853

Change-Id: I878cc7d463ae30090ba55a886e59d7ed2c4fd647

Merge commit '876ede6'

Conflicts:
bundles/org.simantics.acorn/build.properties
bundles/org.simantics.charts/META-INF/MANIFEST.MF
features/org.simantics.acorn.feature/.project

Sync git svn branch with SVN repository r33406.

RouteGraph related methods are now public for code reuse

refs #3832

Change-Id: I44e4a4ca72aea8c7514faa24533602dfeb4b565c

Removed useless TODO comment from TrendNode.

refs #6547
[PRIVATE-11736]

Change-Id: I0d9b7f0ed0ba60d33ac5030813c6912900197e47

Added support for JSON PlainTextTransferable to charts and subscriptions

With these changes dragging JSON text using
org.simantics.ui.dnd.PlainTextTransfer on top of model browser charts
and subscriptions and also on a chart editor is now supported.

The dragged JSON data must be in the following format:
<pre>
{
    "type" : "variable",
    "uri" : "variable space URI to dragged entity",
    "defaultPropertyUri" : "variable space URI to default referenced
property variable of the dragged entity"
}
</pre>

Only "type" and "defaultPropertyUri" keys are required.

refs #6844

Change-Id: I3684a879a6c80bbff812166d14aa28eac5244663

Fixed regression in TrendNode.

The regression was caused by change r32901 and merge r32981. The problem
was that the code tried to keep existing VertRuler nodes alive as much
as possible to keep their (transient) settings in place between chart
configuration reloads. However the code failed to do this correctly and
caused IndexOutOfBoundsExceptions and other corollary failures.

This fix needs to go into platform branches 1.22.2 and 1.22 as well.

refs #6547
[PRIVATE-11736]

Change-Id: Idb7d9d77b1a6b0bf513a5829b4c373cde9747529

Fixed bounds calculation for flags and diagram profile monitors.

NodeUtil.getLocalElementBounds did not recognize flag table flags from
the scene graph. Also TextGridStyle.calculateStyle used wrong method for
transform calculation which causes profile monitors to be positioned
incorrectly.

refs #6837
refs #6812
[PRIVATE-12779]
[PRIVATE-8884]

Change-Id: I0700b969347a692ed8d4ff8ec0a5d2c3be781fc1

Include org.apache.batik/1.8.0 in org.simantics.g2d feature.

After including org.simantics.diagram.svg into the org.simantics.g2d
feature in commit:229196a1cb46a94d1cc5f75aef7f822157ba7917, the feature
started requiring org.apache.batik(/1.8.0). However, it is not included
by the feature which can cause product/feature configurations to be
invalid.

refs #6621

Change-Id: I4a30c0ae569d64e2acccb35a3345d795accc8d5f

Merge "Remove deprecated SIMANTICS-README.mediawiki."

Remove deprecated SIMANTICS-README.mediawiki.

Currently org.simantics.workbench feature includes this old and
deprecated file as a root file to all product builds that include this
feature.

refs #6835

Change-Id: I5a128bf6ac32d2aee7d3b392ca26045f915fb064

UCs can have their own SCLModule definitions

User Components now see their own SCLModule definitions without
including them to the index roots SCLMain. Makes UCs more individual and
eases the usage of them.

refs #6514

Change-Id: I55e5bc78a1dc93382d9ca8d3ea78837baa59fe28

Re-export org.simantics.db.management dependency from org.simantics.

org.simantics has API that publishes/uses interface ISessionContext. It
is defined in org.simantics.db.management plug-in. Therefore
org.simantics.db.managment must be re-exported.

refs #6795

Change-Id: Ieec3e0c8dcb02876057a0a351b426e0d915d7b16

Merge "Introduce utility class org.simantics.db.function.DbOptional<T>."

Include jackson-core in org.simantics.scl feature.

org.simantics.scl.data now requires jackson-core so it needs to be
included in the feature that also includes org.simantics.scl.data.

refs #6683

Change-Id: I275b8ee3dc72cd8871026df8c1e362474edac902

Introduce utility class org.simantics.db.function.DbOptional<T>.

The class is a direct copy of java.util.Optional<T> but it uses
DbConsumer, DbFunction, DbPredicate and DbSupplier instead of the
standard Java 1.8 functional interfaces to allow the DbOptional methods
to throw DatabaseExceptions for cleaner database code in certain
situations.

The rationale behind this class is much the same as with the standard
optional. See e.g.
http://www.oracle.com/technetwork/articles/java/java8-optional-2175753.html.

refs #6829

Change-Id: Ibf62a56eb227264cbfac359aca99d87570b68a47

Added jackson dependency to org.simantics.scl.data for Data/Json

Change-Id: Ie11a770e88808b99fe0d3a3919969d45235a7835

Include Jackson XML/CSV dataformat libraries in external components

The following new bundles were added:
* com.fasterxml.jackson.core.jackson-annotations/2.8.0
* com.fasterxml.jackson.core.jackson-databind/2.8.5
* com.fasterxml.jackson.dataformat.jackson-dataformat-csv/2.8.5
* com.fasterxml.jackson.dataformat.jackson-dataformat-xml/2.8.5
* com.fasterxml.jackson.module.jackson-module-jaxb-annotations/2.8.5
* com.fasterxml.woodstox.woodstox-core/5.0.3
* stax2-api/3.1.4

The following upgrades were done:
* net.ucanaccess/3.0.6 -> 3.0.7

refs #6830

Change-Id: I7ec6ad098d9c2ad8d84faa0a444aa6afd02b0826

Include org.simantics.{fileimport,spreadsheet.fileimport} in SDK build.

org.simantics.spreadsheet.fileimport needs org.simantics.fileimport and
org.simantics.spreadsheet isn't actually in any way dependent on other
org.simantics.spreadsheet plug-ins.

refs #6621

Change-Id: I79723b78aacf5397167dc8b274d4c51c400dcc00

Lots of small fixes for the Simantics SDK build

* org.apache.batik/1.8.0 is taken from external-components/manual now.
  Removed it from this repository.
* org.simantics.sdk now includes plenty of previously missing plug-ins
and features: org.simantics.help.*,
org.simantics.spreadsheet.fileimport, org.apache.pdfbox*,
org.simantics.tests.modelled*, org.simantics.diagram.svg,
org.simantics.browsing.ui.nattable*
* many build.properties fixes, e.g. removal of non-existent files and
addition of missing binary/source artifacts
* added new feature org.simantics.help.addons to bundle together all the
recently added org.simantics.help.* plug-ins for modelled help page
construction in the Simantics Desktop workbench.
* added new feature org.simantics.browsing.ui.nattable.feature to gather
together org.simantics.browsing.ui.nattable and its external component
dependencies (nattable.core, fastutil)
refs #6621

Change-Id: I203c1fac381325d59925e19e26ee338db7ff9852

Merge changes I8832696c,I7ff3a4d5

* changes:
  Refactored RouteGraphConnectionClassFactory code into RouteGraphUtils
  Fixed record-type value editing in the old property tab implementation

Refactored RouteGraphConnectionClassFactory code into RouteGraphUtils

This concludes a refactoring started over 4 years ago.

refs #3832

Change-Id: I8832696c12038c74d0e28a7f0851de142d947a48

Fixed record-type value editing in the old property tab implementation

refs #4583

Change-Id: I7ff3a4d57df864a38132c7551dedb829d5d78036

SVG editor tab contribution did not work due to missing SCL include

refs #6825
Change-Id: Ia11388204986d9dbbd6cd432f0c4d3f15e4c523d

Initial version of SVG tab contribution

refs #6825

Change-Id: I412379dcd53e307962b807b087cf6e243fe37b03

Initial version of SCL tab contributions

refs #6824

Change-Id: I677f82bc7a0cd5ec03937384d9a130c00ddefa9b

Merge commit 'b9450ae'

refs #6812

Fixed Typical inheritance profile style implementation for I/O tables

Now all transforms are calculated properly using
DiagramGraphUtil.getDynamicWorldTransform in
the default case. This fixes the highlights for flags
that are attached to a diagram template flag table.

refs #6812

Include org.apache.poi.feature in org.simantics.spreadsheet feature.

This replaces the inclusion of only the org.apache.poi plug-in which
does not include all the dependencies required by Apache POI.

Also, exclude source org.apache.poi[.feature] source bundles from build.
Since there is no source bundle for org.apache.poi 3.15.0 so we must
exclude it from the build to get the build to pass.

refs #6813

Change-Id: Id5f388596c73f1ec58f93c884ad630e40f74d24c

Include org.apache.poi 3.15.0.b0002 feature in target platform

refs #6813

Change-Id: I9c90784a8e5e6c647fe8370b65ea60393164ba32

Possibility to skip bytes when reading InputStream in SCL

Lift InputStream.skip() to SCL API.

refs #6821
Change-Id: I2462d9474b4eedb5010deb8737cccb507905ba11

Introduce WrapLayout to replace FlowLayout

FlowLayout does not really flow components into separate lines when they
overrun their horizontal space. WrapLayout does this.

Also moved the contents of org.simantics.utils.ui.awt into
org.simantics.utils.ui.internal.awt since that code was never meant for
public use. Moved WrapLayout into org.simantics.utils.ui.awt and
published that package.

refs #6814

Change-Id: I65600f9a5edff021ab011d980bb3352f6141177f

Depend only on org.apache.poi/3.15.0.

refs #6813

Change-Id: Ibb75d457a908e43ee01a8579d3bd4c1414c6d20a

Use direct repository links instead of composite repository link.

There seems to be problems with Tycho and composite repositories and
furthermore, otherwise the composite repository would always have to be
bumped separately to get updates to clients.

refs #6813

Change-Id: I90f164f8df1048340b30fb6f2c33823323a0c632

Cleaned up external components list in target platform definition

refs #6813

Change-Id: Ia8bfa159767af3e088cc3ba38fbec7fa2e494e48

Added back dependencies of org.apache.poi 3.15.

Added org.apache.commons.codec, org.apache.commons.logging,
com.github.virtuald.curvesapi, org.apache.xmlbeans back to external
components to be used by org.apache.poi 3.15 which will be manually
bundled.

refs #6813

Change-Id: I9dbd405a0106a8b05e22d35bcf7a187584b86e57

Added org.apache.commons.collections4 as external component.

This change also removes org.apache.poi.{,ooxml,ooxml-schemas} from the
external components as preparation for including manually bundled
org.apache.poi bundle version 3.15.0. org.apache.commons.collections4
was added because it is a dependency of this new version of POI.

Due to org.apache.poi.{,ooxml,ooxml-schemas} containing split packages
it is just easier to bundle the POI JARs into a single bundle to keep
bundle class loading happy.

refs #6813

Change-Id: Iefd4b52c0fafc4a0e7b6b9ed2bf6bac0e38a113e

Adding org.simantics.acorn.feature

Adding to features/pom.xml - fixing tabs to spaces

refs #6726

Change-Id: Ifbb02b4b63d86dd8cfa35c3854d12f5bf4e86c57

Fixing wrong ID's for modelled tests

refs #6726

Change-Id: Ibf9cda50e406e1e84d8afb28760cbe06f6a03b9a

Merge commit 'b3da313'

Sync git svn branch with SVN repository r33392.

refs #6751

Sync git svn branch with SVN repository r33392.

refs #6751

Merge commit '5da68e7'

Sync git svn branch with SVN repository r33390.

refs #6809

Sync git svn branch with SVN repository r33390.

refs #6809

Merge commit 'd7afa23'

Conflicts:
bundles/org.simantics.db.layer0/src/org/simantics/db/layer0/adapter/impl/EntityInstances.java

Sync git svn branch with SVN repository r33389.

refs #6726

Sync git svn branch with SVN repository r33389.

refs #6726

Merge commit 'c46f0ff'

Sync git svn branch with SVN repository r33386.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Sync git svn branch with SVN repository r33386.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Merge commit '31664b6'

Sync git svn branch with SVN repository r33382.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Sync git svn branch with SVN repository r33382.

refs #6803
[PRIVATE-12714]

Use Layer0Utils.getDomainOf

The result can be cached by several uses.

refs #6800

Change-Id: I65c32408b1afdc1ca96de126e7ac86c46896b250

StructuralConnection added into Simantics/Structural

Also added getter structuralConnectionConnectionPoints

refs #6799

Change-Id: If9fe0b432437624b5fa082d042ffac9bd176ebca

Added property SEL.hidden that is tested in VariablePropertyRule

refs #6798

Change-Id: I0a23da64589abef202a3ac3ee9a5ee2210703b01

Fixed to remove duplicates

refs #6797

Change-Id: Ifb3bd95855c47b3cf424a1ec7ee5364b3aef4597