Replace instantiations of DatabaseException with more specific

gitlab #92

Change-Id: I3030bdb2d02492783bda2ca8118c96b48b734c13

Possibility to open SCL-modules from plug-in in JAR-file

The real NPE problem was already fixed in c52bf8a8 by Hannu, but this
adds some SLF4J logging.

gitlab #77

Change-Id: I9ce2e1efca375046b0b5f8a5dd483e1e288d594a

Replaceable Defined Component Types

gitlab #83

Change-Id: I26ec5d8f6a66805999663e0856601e5ab2f98cb0

More SCL functions for experiment and run handling

gitlab #91

Change-Id: I8ee4adbc8f375a7dc61df45e21f5ffe5582d84b8

Merge changes I2aa561cb,I9eb9be8a

* changes:
  Avoid unnecessary ElementClass validation work
  Switch MapList to use Java HashMap

Avoid unnecessary ElementClass validation work

GraphToDiagramSynchronizer.SubstituteElementClassImpl can safely ignore
ElementClass validation checks which speeds loading up a bit for very
large diagrams.

gitlab #90

Change-Id: I2aa561cbad8de034362a4a298272d3faa8242537

Switch MapList to use Java HashMap

Java HashMap is more efficient than Trove THashMap already in JDK 8.

gitlab #89

Change-Id: I9eb9be8a513ad1cd90b8f6f4a45aca99bba9234b

Merge "Debug logging through SLF4J Logger for Expressions"

Merge "Generic <String, Object> property map for tree node structure"

Merge "Disabled BOOKKEEPING flag for normal use"

Debug logging through SLF4J Logger for Expressions

gitlab #88

Change-Id: I7917e8a207e99bf92feab50291bcb3d85e108cf3

Generic <String, Object> property map for tree node structure

Allows requests generating these nodes to mark them with any data to be
used later in UI or elsewhere.

gitlab #87

Change-Id: Ifa0e0d6cd9be342057ff150e721cebe50105197f

Disabled BOOKKEEPING flag for normal use

Also fixed all compilation warnings from the file.

gitlab #5

Change-Id: I5697ade4a1443df565dd19f78fa1ce044ae97169

Performance and resource consumption optimization for G2D picking

* Scene graph R-tree based spatial optimization of picked
  IElement-material resolution
* Parallel processing for both resolving the elements to pick and
  picking the elements
* Added INode -> IElement map management to ElementPainter to have the
  fastest possible means available in picking for getting from scene
  graph nodes to their corresponding IElement instances.

gitlab #66

Change-Id: I524da0c2695cdda2eb4f0a1fa318f48ff8fcff24

Fixed DirectQuerySupportImpl small cluster String value retrieval

Previous too-optimized implementation had multiple flaws:
* Index calculation did not have enough parenthesis in it which meant
  that the value table index was sometimes calculated incorrectly.
  This lead to string literal values being read incorrectly.
* Did not take into account string literals longer than 127 characters
* Did not take into account that string literals are modified-utf-8
  encoded and simply decoded them as US-ASCII bytes. Essentially all
  resources with name containing special characters were indexed
  incorrectly up until now.

All of these flaws have been in the code for ages.

gitlab #86

Change-Id: I500114d3e2cff76370433b929ec8b8124659ce33

Render last known value in time series chart hairline value tip

Previously if a history item's data stream did not (yet) contain a value
with a timestamp >= than the chart hairline time, the value time on top
of the chart would not paint any value at all for that item. The best
thing the chart can do in such circumstances to prevent unwanted visual
skipping in the UI is to paint the last known sample's value regardless
of its endTime value.

gitlab #85

Change-Id: I362a19b8699c8c4a96240ddfc3fd68a91d6bbd06

Check if root allows paste only for non-null target root to prevent NPE

gitlab #84

Change-Id: I7d736e78928bc203bfb05e72af31e16d204bdc32

Fixes based on feedback

gitlab #5

Change-Id: I39ecea8bca9bc518ec746bf3e306aca09e9f9237

Improved Bindings.getBinding(Class) caching for Datatype.class

Previously Datatype.class binding was never cached nor statically
constructed and made available as Bindings.DATATYPE which is only
sensible because Datatype class is a central building block of Databoard
and therefore its binding should also be readily available instead of
all clients having to request for it separately.

A weak hashmap cache was also added for signature strings in
BindingRequest because it was noticed that in conditions where code
makes a lot of requests for uncached binding, the cost of String
construction in BindingRequest.getSignature starts to dominate
cpu/memory costs. Two main problems in there were: constantly creating
new strings and using the very inefficient String.replaceAll instead of
String.replace(char, char).

gitlab #82

Change-Id: I50fbbc2bbe1e5d6b8b5864c3aed4c228022e66dc

Rest API for Historian data

gitlab #40

Change-Id: I4bc9cc2dec3d3c2dcf902d372fc895b073d5e767

Updated SDK target platform to include org.eclipse.jetty.servlets

gitlab #40
gitlab #81

Change-Id: I500ed8c006785c07852054ace1519046d9885687

Include org.eclipse.jetty.servlets in SDK external dependencies

This takes version 9.4.5.v20170502 which is the same as the Jetty
plug-ins provided by Eclipse RCP SDK the current SDK uses.

gitlab #81

Change-Id: Idb2f93f0d79fe3656fc745860d8e6ccce1bb1d1e

Use given base name when exporting tg file along with shared library

gitlab #79

Change-Id: I7cec6fe1546475a40de09514d8aeb8b219b290fa

Attempt to fix regressions in new code base

gitlab #5

Change-Id: I0a72d8f68f448b9b775deb403146947bac107049

Removed contact application support prints

Unnecessary contact application support on error messages removed.

gitlab #76

Change-Id: I6f3940fa5443e52eb7c9e21c7578579158b468c3

Remove duplicate InputChannel inner classes

gitlab #73

Change-Id: I5ef3948f8b3437345536bd7e121cb3443d8fe26f

Remove error in ClusterChange isLoaded()

gitlab #75

Change-Id: I2014788d390d581a9b185f2a25150619895f4acb

Always write model activation information in activations VG

gitlab #72

Change-Id: Iae03fee489bfb3b50797dc2cd271e65ec535133a

Merge "Multiple reader thread support for db client"

Multiple reader thread support for db client

gitlab #5

Change-Id: Ia5c189525f2f8277bfc10234c41a1ae47082bb15

New splash.bmp with version 1.36.0

gitlab #71

Simplified release engineering instructions

gitlab #71

Simplify release branching as much as possible

Now the release-helper.sh script has a single action
branch-release that can be used to do everything related
to normal release branching except pushing the changes to
origin.

Also the action bump-master-version simplifies the version
bumping done for platform and simupedia master branches
after a release is branched.

gitlab #71

Change-Id: I71d7936a610b2f3a5228405680779bb3ae2e2ed7

Bumped master version to 1.36.0

gitlab #71

IConnectionPoint and canBeConnected-checking util to SCL

gitlab #67

Change-Id: I7bcb4a3c415dd480cc7b4621ed6b18f1a277d83c

Functions for manipulating column beans

gitlab #51

Change-Id: I27a62a07324fa3dc48f5d80efa660881f85940a1

Support for multiple installable TG files in single bundle

gitlab #50

Change-Id: Id3f11ec8fbc4a3276fe7c48e538996542e768312

Change mode to operation in Spreadsheet when changing sheets

gitlab #70

Change-Id: I0735e72d817b3d1c7287ecfe0c6e2473bac32a01

Added static handler without event as input to AssignSymbolGroupsHandler

This minor change is needed by sysdyn to be able to add Modules to
symbol groups.

gitlab #69

Change-Id: I7df2c397a299e1a49a7912809fa7773917e6cfe3

Make transformChanged and dropQuality abstract in NavigationNode

gitlab #63

Change-Id: Iac86a4a40292597408a78903a372ee779c93b111

Option to disable duplicate MouseWheelMovedEvent in G2D EventQueue

gitlab #64

Change-Id: Ifda3fb71ac2ddc71fc94dfdc198841a55e166953

Merge "ResourceSCLTextGridStyle for creating Resource-based monitors with SCL"

Merge changes I7cd072f0,I499dc390

* changes:
  Add progress monitoring for DeleteHandler
  Improve performance of CommandMetadata (de)serialization

Add missing images back to SILK

The images are time with a rainbow and an italic font F, both used in
old versions of Sysdyn desktop.

gitlab #68

Change-Id: Ibc441c67f7599ea0a83940cbe2fa9ae240ea79d5

Customize NavigationNode for PanZoomRotateHandler

gitlab #63

Change-Id: I127743304e9ebae068c961e9929a18fb17115a08

ResourceSCLTextGridStyle for creating Resource-based monitors with SCL

gitlab #62

Change-Id: I17b33e561ff5194e8ebaaf4522d702b222e762cf

Add progress monitoring for DeleteHandler

Current implementation does not give any hints when deleting e.g. 10000
resources

gitlab #61

Change-Id: I7cd072f0adbfe02c9ee8f0e80350bec44a6e7c20

Improve performance of CommandMetadata (de)serialization

gitlab #60

Change-Id: I499dc390e84a733e9a890164695a79ad2a40e05f

Add max digits for ruler node for subclasses to override

gitlab #59

Change-Id: I7063af75d8ae1190271386a8441b90ccec7342af

Prevent paste to resources that are `L0.Entity_published`

gitlab #57

Change-Id: Ie4728421bca56ba0c10ae03d08f99123faffa1f1

Updated file importer interface and fixed Spreadsheet import

Spreadsheet import through the generic file importer always failed,
since the books cannot be imported to Development Project. Now the
generic file interface takes this into account and provides the
selection as a resource. Currently only ExcelFileImport uses

Amend 1: Changed the way the selected resource is found
Amend 2: Take into account Tuukka's review comments (1,2,3 and 5)
Amend 3 and 4: Changes by Jani and Miro to fix some issues with the
interface

gitlab #53
gitlab #56

Change-Id: Ibfb9d54d8c36a3dc2aa7da8f1043613159ae8383

Spreadsheet updates cell values properly

Cells referencing other cells weren't updated after change
"8c8283a01e63980527d605936286747006bea601" (see in History view), in
StandardNodeManager.java. I added a new setValue function that takes a
list of Nodes that need to be updated (removes them from valueCache),
which allows only specific cells to be updated when another cell is
updated.
I also removed invalidation code from Spreadsheet's "All.java" class and
added them to the value updated in SpreadsheetNodeManager, which
invalidates recursively the cells the use another cell.
I also made sure that SpreadsheetCells jave the same properties through
their life-cycle, rather than creating a properties map whenever the
properties are called.

gitlab #48
gitlab #54
gitlab #55

Change-Id: I125f644e014310937ed7697e9f44ec33825f9b0f

Spreadsheet Fixes

-Fix ArithmeticExpression + and - String cell value evaluation to check
for number properly.
-decodePossibleCellAbsolute by location rather than decodeCellAbsolute
in "getPossibleCellEditor" to avoid error being thrown unnecessarily
when trying to access cells by ID "Headers" (which is not a proper cell
ID)
-Update cell content expression after change rather than leaving the
default value.

gitlab #43
gitlab #44
gitlab #45

Change-Id: I8a89d86f6cdfd0651a36176a69066b8faa4faeac

Utilities for listing of statements in DB

gitlab #42

Change-Id: I5d79c2542cffaff56cb6e6405c466e030115c7c3

Re-export simulation.sequences in simulator.toolkit

gitlab #49

Change-Id: I12435be168e141efb69691d1dbe3cf8a92c4f8bc

Merge "Use Runtime.halt instead of System.exit in delayed shutdown"

Use Runtime.halt instead of System.exit in delayed shutdown

Change-Id: I4c43ff1f73639948bcefa4bf3c41cf4a06ff6b95

Getter for experiment from DynamicExperimentActionContext

gitlab #47

Change-Id: I287952c70b5540b6ec4491cacba4a2804510b684

Merge "Better emptying of trash bin"

Merge "Block external and excluded seeds in ConsistsOfProcess"

Better emptying of trash bin

Statement removal was broken in write only request. TG remover did not
correctly manage internal resources. Added hardening against errors.

gitlab #32

Change-Id: I120fcbdb7077e0f037104331480a2b1ab090d798

Add workbenchselection json fetcher to SCL interface

Requires some small refactoring changes to AdaptableHintContext and
classes using it, which is why so many files were affected.

gitlab #41

Change-Id: I35bc8abe9e1eca8ff34ee503925645ee14d41664

Block external and excluded seeds in ConsistsOfProcess

refs #14162

Change-Id: I3d8048ee763b5e41e0b9835afcb129ad50b88025

Force platform shutdown after some delay when workbench is closed

gitlab #37

Change-Id: I6ab788e55824dbc3b2dd656cbb6ead407e35938a

Graph debugger: handle case where assertions does not have predicate

gitlab #38

Change-Id: I85b9b2c014b44bcaec7cf3117b87df1215143435

Added safety to release-helper.sh

Change-Id: I4505f0e6c935a94ebd4a869e39455fe6ff10b91c

History data collector did not collect min/max/avg values correctly

gitlab #35

Change-Id: Iabc44ba0d8fb8a0348f27df07cd4d114975c4d0d

SCL API for GraphFile plug-in.

gitlab #34

Change-Id: I81b9d41cfa392545df629bf9e7a6197c21effa58

Modified UTF-8 decoding fixes for TG reading and indexing

gitlab #33

Change-Id: Ibd4239b76d1d88fe4303bec9d7cc407d15e8505b

Inlined Prelude/maybe

gitlab #31

Change-Id: I88298efc212596ad57adf468ed54b8f268050126

Added Prelude/maybe

`maybe def f v` returns `def` if `v=Nothing` and `f x` if `v=Just x`.

gitlab #31

Change-Id: I3319ee8e9e4cf678aece4878c1fb2ddf33395bc4

Generic OpenDiagramFromComponentAdapter

gitlab #30

Change-Id: Ib17df6e2a29642aa2e98976e4ad8df0cafd4e72e

Added exception safety for createHistorySamplerItem2

gitlab #9

Change-Id: I2a5894b73a638aad3e05ee42d0b10e40d60f3270

Async utilities for SCL

* scheduleAtFixedRate
* scheduleWithFixedDelay
* schedule

gitlab #23

Change-Id: I72ab85f4458a17a83fa4de95bc668d8fadac1d50

Allow ExecutorWorker thread pool shutdown

Also made the pool spawn daemon threads to allow shutdown regardless of
whether the pool is shut down or not.

gitlab #29

Change-Id: I680e15407c0fd0586070a212d291efd44dc28f5d

Reinitialize visible diagrams after shared library migration

gitlab #28

Change-Id: Ie3f8f5c90ed98490e2f03f1c955995d30b9a3923

Prefer methods with more parameters when resolving importJava

gitlab #27

Change-Id: Idd6ec1a08f127a503c456cea45f5bda7dbf9703a

HistorySampler.sample(HistorySamplerItem2, ...) now uses mipmapped data

Implemented selection of sampled history data source based on the
seconds/pixel (= timeWindow / maxSamples) ratio provided to the sampler.
This is one way to attempt not sampling too much data for trend views
that cannot inherently handle large amounts of data.

gitlab #9

Change-Id: I8c67068d6e832d33d4ac3adef270d31f1cb0e722

Upper bound to ANTLR version range

gitlab #24

Change-Id: I23967ea9b3e4bc6960f83b6d22bd3f3a80e3b43b

Fix ANTLR package versions

gitlab #24

Change-Id: I9c9cdbe4fe3f27364f7248822942bca75a268525

Removed org.simantics.ltk[.antlr] bundles, exact import for antlr

gitlab #24

Change-Id: I582628d505edcec5565e768a42b984fdb3e096fb

Removed extra debug/timing prints from graph compiler

gitlab #25

Change-Id: Ibeb73046154a53595acd3bb31e51551c4b5c9fe5

Restricted version of imported ANTLR packages, compile with 3.5.2

gitlab #24

Change-Id: Ie5bace3044f290d400a17c2bbe97774429c86ba8

Improvements to Lucene indexing

refs #7750

Change-Id: Ie93ff3058882bc61835d25d72440031c240be494

New implementation of server state based on StandardNodeManager

gitlab #20

Change-Id: I51e56095fb1e76b4c67945eead07d1e9da54eed4

Modernized release engineering instructions.

Worked around Windows FS problems in IndexedRelationsSearcherBase

See https://blogs.msdn.microsoft.com/oldnewthing/20120907-00/?p=6663/

gitlab #19

Change-Id: Ia12c848aa75836597121eadec05061ea23bb1240

Prevent NPE if the path to the module source cannot be found

gitlab #18

Change-Id: Iac92cfae81f8caffa5c8dfba129e3e9868801e82

Fix for empty cancelled write transactions leaving scheduled updates

gitlab #15

Change-Id: I844dab6a59df56f2097a507bcd6b6d3ec75124b1

Bumped master versions to 1.35.0

gitlab #16

Change-Id: Iafe0abeaffca3d15c35c629f7fe2eb4aaac437a5

Use SLF4J Logger in SessionRequestManager.

gitlab #14

Change-Id: Ia79a0fd4b895f02f98c6113cd1ca9fe95104c9d0

Merge "Fixes to thread safety problems in SCL compiler"

Fixes to thread safety problems in SCL compiler

gitlab #12

Change-Id: I0b0aec3bb71138a5033ae2337178c86ff04f5e59

Improvements to SCL HTTP client

Add missing Proc effect to buildClient function. Function to read
content length from response. Function to read headers from response.
Option to add read / write progress callback functions.

gitlab #11

Change-Id: Iaff99e05e35a494b154d7d5b04bd936bb95b0407

Fixed ComponentCopyAdvisor to account for L0.TypeWithIdentifier properly

The previous fix done for the same problem in Simantics redmine issue
7842 and commits
c912edf13bf5a91b2f6dc855f54d8728aa0a64f5,
803c42fd316859809eaeb3dc6a88b22cbf86b4b6 and
0cfc6a9b8b186ba432bc6758c089726b1471fd1f was simply wrong. Using
ModelingUtils.needsIdentifier is the most proper way to fix this.

gitlab #10

Change-Id: Id7cdc32a6596588154913fced742d751ce6ba864
(cherry picked from commit 290c3cfc8bf5a7b2cc6e8532f124512e0bf10517)

Merge "Added another sampling method to HistorySampler"

Added another sampling method to HistorySampler

This intentionally doesn't replace the original history
sampling function since it might be used elsewhere.

gitlab #9

Change-Id: Ie7ea8f37f29a5a277a6678e7716e340884d30e69

GraphList: List interface to linked lists in Simantics database

gitlab #8

Change-Id: I87a1dc12d84c7875db075dec09ad08a60d8e40d1

Merge "Fix column width issues on HiDPI displays. KeyTiSelection fixes."

Fix column width issues on HiDPI displays. KeyTiSelection fixes.

gitlab #7

Change-Id: I03a51472f2e9d38a78e38b92617d0e9f975f6c54