Support for dynamic transforms for both elements and terminals

Includes also minor code warning/logging cleanup.

refs #7119

Change-Id: I2df8f0f0707e8adf1569679ab41a74f605ae1268

(refs #7242) Fixed NPE in SCLModuleTree

A null input must be handled when the component is disposed.

Change-Id: I915c68aa3d15b4d5a3cbd89220bd3701f262fee1

Added procyon decompiler to target platform

Change-Id: I0bfad66709f89c3c27f16311d3adde69b80afda2

(refs #6923) Explicit export annotation for SCL modules

Added module export list to module header. It looks like this:

module {
    export = [foo, bar]
}

When using export list, @private annotation is not supported anymore.
All symbols not exported are effectively private.

Change-Id: I7827f6cf6062388ddd06be0ab401409bd08464fe

Jersey HTTP Client - increase .target's sequenceNumber just in case

#7243

Change-Id: I455326fbad7adfff04fa0a23a50ab689d3091e7b

Merge "Add missing jersey-server for Jersey HTTP Client.. does not make sense.."

Add missing jersey-server for Jersey HTTP Client.. does not make sense..

#7243

Change-Id: I378c43b1d9f72dc98b9f23d790c544238fe177f3

Merge "(refs #7242) Refresh button to SCL Module browser"

Merge "Jersey HTTP Client - Remove (hopefully) unnecessary dependencies.."

Jersey HTTP Client - Remove (hopefully) unnecessary dependencies..

Change-Id: I7e532295639158da7f0971cd75252a0068406b3e

Merge "Jersey HTTP Client - Why "-" is not good enough for versioning?"

Jersey HTTP Client - Why "-" is not good enough for versioning?

#7243

Change-Id: I98952ab61b6e4ef1a37795bab2a530772a2761ae

Jersey HTTP Client - Oh my ruis, yet another version mismatch

#7243

Change-Id: I0be124f994a3ed777c48792a68de59e489a3c3c8

Jersey HTTP Client - Ok now I get how this works

#7243

Change-Id: I69fa5d738663f0dee462a41841097bc70f9f7e6e

Jersey HTTP Client - Still going strong

#7243

Change-Id: Ied41cc202f0efb01aefacd737b673e47eb209960

Jersey HTTP Client - almost finished :)

#7243

Change-Id: Ie7f79a9980ddb2e8c9d60dfb76f670a30267f400

Jersey HTTP Client - Wrong version numbers..

#7243

Change-Id: Id0af2b5d4caae2dfc12d87b2b2d5d94b5cc4df5c

Forgot to update logback and slf4j version in target files

#7243

Change-Id: I24e9e8ef33f856c4eb826c58bfee7dec5acc86ed

Adding Jersey HTTP Client to target platform

#7243

Change-Id: I004c550f611b2dec92c9a680e62d023ea1095ea3

(refs #7242) Refresh button to SCL Module browser

Change-Id: I51a7441fc6fe702b6f7fc4410b67e24e6d788ae4

Added null check to StreamingTransferableGraphImportProcess

refs #7240
Change-Id: I5724ddfff4eae6c17dcd92eff71e25fb80bc8cf6

Merge "StreamingTransferableGraphImportProcess assumes index root cluster set"

(refs #7242) First version of SCL Development perspective

Change-Id: Ica1a3d93c05e11ccee2cab3c0cf517cbe332106a

StreamingTransferableGraphImportProcess assumes index root cluster set

refs #7240

Change-Id: I32ef3d78a8c278849fa6a44052a85e61510a72f5
(cherry picked from commit b8403a3565fc946a389ea509ef8fd4067610fa00)

LayerCleanupMigrationStep is too eager

refs #7241

Change-Id: Ia389c085b09270a9bea5479ffaefbb2eb08a1ef7

Better and prettier printing

refs 7224

Change-Id: I6afdcfe04f4cef811c514b1c2f42478ebee30646

Merge "Support DB images in url requests"

Merge "Console printing also for content prints"

Console printing also for content prints

refs #7226

Change-Id: Ia95b0d5e2432d8a9a2697a9184dd268a6c1fb8ab

Support DB images in url requests

refs #7237

Change-Id: If642626d1ee420af0c694f48a3304cd51455465c

More console printing

refs #7226

Change-Id: I255d30cc7188e6aff2111952b1a37ee4c755be68

Check head.state file existence before validating its integrity

This prevents unnecessary NoSuchFileExceptions from being logged at
startup.

refs #7124

Change-Id: I500c937ec8894f6c97dcfe73b01efc4adc9b59a6
(cherry picked from commit b4e846e4206e688050b659f2d66581d26e3dc1ce)

Merge "(refs #6878) Don't validate SCL expressions in console input area"

(refs #6878) Don't validate SCL expressions in console input area

Change-Id: I49ab2879aaf55bddf1e47c980bd944fbe32e2f5a

Calculating bounding box for dynamic symbol fails for empty TSpan

Replace empty content with dash as a workaround.

refs #7231

Change-Id: Iac8257d12d4a6201f766a7458c6315ab5e84f113

(refs #6178) Added missing dependencies of kryo to target files

Change-Id: I26acf11b3218ec6a6ac0716abcff23dbdf326743

Merge "(refs #6178) Added Kryo serialization library to target platform"

(refs #6178) Added Kryo serialization library to target platform

Change-Id: I419b756f648a40a4f3809bb5eb8e1d6b8c399d1b

CompilePGraphs takes previous bundled version of ontology

#7229

Change-Id: I71520cf139aa4131031a59bd377ca82410d36044

Make NodeContext builtin keys available through Simantics/All

refs #7227

Change-Id: I8890d36f31feac77fcda9f9684b7cab86c7d8f91

Console printing enhancements for documents (Simupedia)

#7226

Change-Id: Ib6f67ee6461dd3cec7d22b60c784631b065a4caa

An action to show a pgraph for resources in ontologies

#7225

Change-Id: I358fc705d5a7afcb20edb6520019a3689a978cd7

PrettyPrintTG enhancements

refs #7224

Change-Id: Ieff6b12540bc1c1e076ddda376d59e0b3529a791

Ensure ExperimentUtil.scheduleShutdownActiveExperiment invokes callback

This needs to be done because calling parties may rely on getting the
callback.

refs #7220

Change-Id: Ie81c20da8da9d734afe7f98cf1117176b2f2dc9d
(cherry picked from commit 51239a7b24d812eec59b7f635ed0cfd9d116a268)

(refs #7219) Remove deprecated code (scl.compiler.dummy and editor)

Change-Id: Ibd2bc7b4ca78637460701351b7511dc77ba6ef2f

Merge "Workaround fix for acorn mutex printing for now"

Workaround fix for acorn mutex printing for now

This needs to be fixed somehow else but just a workaround for now to
prevent flooding of prints

refs #7175

Change-Id: Ia218bbfc8bd82679fb7f365c706b74c1753a1795

Merge "(refs #6878) validateOnly flag to ExpressionEvaluator and CommandSession"

Merge "(refs #7214) Treat $ exactly like function application"

(refs #6878) validateOnly flag to ExpressionEvaluator and CommandSession

Added a new flag validateOnly to ExpressionEvaluator and CommandSession.
This prevents the execution of the expression. In command session,
variable types are however updated, so it is possible to run longer
command sequences and check their types. To use the flag, run the script
in CommandSession with static method validate.

Change-Id: I3fbb5501c8a902f2f3ea547d5c5bc7d693df3a77

Merge changes Ib64cf026,I238948da

* changes:
  Enhancements to modelled STS-tests
  Minor SCL enhancements and fixes for logging and test executing

Merge "(refs #7216) Removed OldTransferableGraph1 and all referring code"

Merge "(refs #7218) Sort labels by integer values when generating switch"

Enhancements to modelled STS-tests

Some refactoring and streamlining for the modelled STS-tests:

* Possibility to ignore certain tests
* Streamlined JUnit execution of modelled tests
* Removed duplicate code related to modelled STS test searching
* Introduced Junit/Assert SCL-module for assertions in SCL tests
* Changed STSTestEditor to extend SCLModuleEditor2

Change-Id: Ib64cf026f69e7490a6eb831afd88d909b80ed8b7

Minor SCL enhancements and fixes for logging and test executing

Also fixing Simantics/Misc getSystemProperty to return Maybe String

refs #7217

Change-Id: I238948da90f95b1b7e16d35112acb41eecb75d61

Merge "(refs #7215) Preserve identity types in NamespaceMigrationStep"

(refs #7218) Sort labels by integer values when generating switch

Change-Id: Ic6acb6241151f3d178e4c5bdf9c4fac5424b6100

(refs #7216) Removed OldTransferableGraph1 and all referring code

Change-Id: Idde9dde36c06b5270730036ab7e435f38f59a5fd

(refs #7215) Preserve identity types in NamespaceMigrationStep

Change-Id: Ida23a57053d0bca00523b4a87e6c896810373602

(refs #7214) Treat $ exactly like function application

Converts (f $ p) before type checking to (f p). This slightly changes
the semantics of the language for it is now possible to use $ with
functions like runProc, syncRead etc.

Change-Id: Ida816667a5c9d7623d59ca998a34fe98df5b4732

Added mechanism to diagram IFlagType to prevent graph modifications

When diagram flags are loaded, some implementations trigger graph
modifications because the flag type may know the flag to have wrong
direction information based on analysis of the model. Printing diagrams
to PDF or SVG should not modify the database in any way, just trust what
is in there.

refs #7208

Change-Id: Id2d438c0523ed708a0d11219a8efd6954ac5000e
(cherry picked from commit c92959f34dd3cf5f365d8798839a919840b5487a)

Merge "Performance enhancements for DiagramToSVG"

Performance enhancements for DiagramToSVG

refs #7208

Change-Id: Ieb507e6c9abc287192fff127385cc51f17ebee86
(cherry picked from commit 5655da36b1f5b605b2407b34f1226a9ad60f8ce6)

StyleBase runs cleanup in wrong thread

refs #7206

Change-Id: I607539b6e5aabc947976308b972976ee97b9c4ea
(cherry picked from commit d156f756b493ce0f853fcb5619809812ea764167)

Merge "Fix RouteGraphNode styling"

Merge "Paster.getGraph() method for overriding classes."

Fix RouteGraphNode styling

fixes #7209

Change-Id: I05ea45c1dd01cf9502970e9e99c1a278b2cd73a2

Paster.getGraph() method for overriding classes.

refs #7205

Change-Id: Ie488312ad9b995351a55f557e3686d8e4408ceac

Add org.simantics.db.testing to org.simantics.sdk feature

This adds the plug-in to the build results.

refs #7204

Change-Id: I083ba9da5b8dc60fe8eab167b786663034f6e343

Add org.simantics.db.testing plugin to SDK build

refs #7204

Change-Id: Ifac7487f2a8d232372421e75550dc2e63cd7df5c

Improved logic in new head state creation.

Earlier any IOException during the reading of head state was interpreted
as empty DB. This might cause unwanted DB reset. It's better to identify
need for empty head state based on main state head directory.

Switched AcornDatabase.start logic back to using RandomAccessFile for
touching the db/lock file. Using RandomAccessFile instead of
FileSystemProvider.newFileChannel in Windows better prevents any other
process from removing the lock file. The newFileChannel version did not
prevent the user from initially running 'del lock' to remove the file -
although the file will be recreated quickly by the system.

Also AcornDatabase.start now re-throws ProCoreException if
opening/locking the lock-file fails with IOException to prevent the
system from attempting to start up without a proper database to work
with. Previously the system just logged the start-up problem and
continued.

refs #7124

Change-Id: I850b47d8f692e3d1b8ce177b9269540edc4dc272

FileImportService fails to match file extensions

Extensions always contain leading dot, so match accordingly. Remove
leading asterisk from candidates if one exists.

refs #7203

Change-Id: If8399760c70fcfc1f7822035fc971499621c72c7

Try to acquire DB lock even if the lock file already exists

Lock file may already exist if the program crashed or was terminated
forcefully. It is ok to try acquiring the lock on existing lock file.

refs #7124

Change-Id: I1467dee3d889d18c68664f6df0b9fa9b13296351

Merge changes I09c034e1,Ideac8aae,Ib7751212,Id09d9a3c,I39696ee5, ...

* changes:
  Use ListIndexRoots in migration
  ListIndexRoots request
  SingletonRead base class
  GenericReadBase2 without the unused template parameter
  Initial selection for diagram viewer should be the diagram itself
  Support VP.Test in action browse context contribution
  InstanceOf tester (VP.Test)

Use ListIndexRoots in migration

refs #7198

Change-Id: I09c034e1723ec8bc35706d137f5a8c8cba96a44a

ListIndexRoots request

refs #7197

Change-Id: Ideac8aaeb23154aa94d465b838903f4fa373a458

SingletonRead base class

refs #7196

Change-Id: Ib7751212d5cad181c74a1680962e4c84a43e4ebb

GenericReadBase2 without the unused template parameter

refs #7195

Change-Id: Id09d9a3c8f2752fda0d2b846f69382249374704a

Initial selection for diagram viewer should be the diagram itself

refs #7194

Change-Id: I39696ee530cd04fb91562400f0b4937b30a121c7

Support VP.Test in action browse context contribution

refs #7193

Change-Id: If8237793dda6f6191e0aec06c30573cc2f97134f

InstanceOf tester (VP.Test)

refs #7192

Change-Id: Ife996f7b8dfa7d302877aef7dfad7f4bc711211d

Fixed bad bug related to AcornBackupProvider

AcornBackupProvider was invoking GraphClientImpl2.makeSnapshot with true
parameter which caused the invocation to write the main.state file when
backups were made which was totally unintentional. The main.state file
is now only written only when the database session is shut down, i.e.
not at all in ClusterManager.makeSnapshot.

Also includes robustness fixes for Acorn database directory locking by
using the Java NIO API for atomic existence testing and creation of the
lock file.

refs #7186

Change-Id: Id668528f8aea789945a4ae3a212d14b07554ba0d

Changed external reference flag texts to obey current name/label mode

Text shown in external reference type diagram flags now obeys the
currently selected Name/Label model that can be controlled using code in
class org.simantics.NameLabelUtil.

Previously the text shown in normal diagram external reference flags was
always preferring to show the Label property of diagrams and related
modules and if labels were not defined, the Name property would be used
instead.

refs #7178

Change-Id: I85efb6e68f92fdb18d1445037da5285700ca5398

Fixed BrowseContext test code to work headlessly

Previous code invoked JFaceResources.getDefaultFontDescriptor which
eventually invoked Display.getCurrent which would assert out in a
headless test environment.

refs #7184

Change-Id: I59349b8845b8f41d96356764972abcac44d35022

Fixed bad logical bug from Acorn's MainState.load rollback

The major bug was the logical not in MainState.load rollback which
caused the database revisioning to be started from 0 when the database
was *not* empty. It should have been the other way around.

Also cleaned up the database head.state validation code by not using
exceptions for flow control in validating head.state files.

refs #7124

Change-Id: I7cd57fa73d39a637c71159df63566aed5063fc40

Merge "(refs #7178) Validator for build.properties"

(refs #7178) Validator for build.properties

Checks that certain typical Simantics files exists in build.properties,
if they exist in the plugin.

Change-Id: I3e9303698d19a6f312c2cf2de213849a51744f04

Process disableIndex and databaseId arguments in SCLScriptRunner
application

fixes #7183

Change-Id: Ia83059a2c2331f770245635685b1b4e77887c904

Merge changes I7c81eac8,I15581be9

* changes:
  Fixed URI problems related to EnternalEntities during import
  Removed IRequest references and usage from Document/All

Fixed URI problems related to EnternalEntities during import

Introduced a new function, getTrueUri, that gives the escaped URI.
Used when finding external entities.
Previously, getUri was used, which made finding external entities
impossible, for all User Component's with a space in their name.

refs #7182

Change-Id: I7c81eac8843f98f19054ad5df0b4ee73d2a1753e

Added Simantics/PGraph SCL API for compiling shared ontologies TGs

Moved CompilePGraph action implementation to org.simantics.modeling and
made the code headless. UI problem reporting can be done using the
provided CompilePGraphs.UserAgent interface.

refs #7181

Change-Id: I0c9e7fe5e4916077268651a6dea6c869f08a7d72

Removed IRequest references and usage from Document/All

An recent change (Revision 82ed7c74) to Document/All.scl  added IRequest
usage and references. IRequest should not be used in Documents/All.
82ed7c74 broke SimupediaServer's Request.scl, since
Request.scl uses Document/All and also already had IRequest defined.

refs #7173

Change-Id: I15581be91cc98756025afdd6acbf72318de84228

(refs #7180) Configurable font for FlagNode

Change-Id: I01e041e83ed8d66ad203107c2b4ff1d670756e5f

Added file-extension filter function to Core.scl for Dropins.

Generic file-importer can be asked which extensions are supported. Added
that function to Core.scl.

refs #7154

Change-Id: If9d76c61e19ea543eda9ee23524d18c5d4623ee3

Fix compilation problems from org.simantics.gnuplot/pom.xml

The problem surfaced after putting the maven graph compiler plugin into
use.

refs #7178

Change-Id: Icb660bc39711951c545a50baed945d0d6c3a7996

Added graph compilation goal to Maven build.

Removed graph.tgs and resource files.

Added reference to graph builder repository

Change-Id: Ic7d17214827259fcb02fa881653961d0e8885744

(refs #7177) Rounded connections

Adds HasRounding property to G2D that rounds connections in the
diagrams.

Change-Id: I2f5429f90e926b9569633056d50a233cf9f4c395

Some fixes for resource cleaning spreadsheets in simupedia

refs #7173

Change-Id: I2b8cf12a0abae25f34e691c5251a34fa0e2ab1f9

Merge "(refs #6924) Support for record field access syntax."

Added maxQueueLength parameter constructor for DisposingPolicy.

Previously DisposingPolicy was hardcoded to 8 item queues.

refs #7172

Change-Id: I2b7df0b71483396490ab559271f7531ae80d0822