Removed standard xml packages from apache and import them from elsewhere

Change-Id: I9499e63a4905bea38461d9ead48dcea68ea6f77b

An initial implementation of Json module.

Change-Id: I33668d8cfdcafd91f7f205a49d5660337f2f0c46

Add missing external dependency plug-ins to SDK build platform.

refs #6475

Added org.simantics.fileimport{,ui} to bundles POM.

This fixes the SDK build.

refs #6475

Added com.fasterxml.jackson.core.jackson-core version 2.8.2 to ext-deps

refs #6683

Change-Id: I187c6edff7e58e26093a879b4f184c38f02ac663

Refresh native part of org.simantics.fastlz compilation instructions.

Added Visual Studio 2012 solution/project for compiling with Microsoft
Platform SDK for Windows Server 2003 R2.

Renamed libfastlz-darwin-x86_64.jnilib to libfastlz-darwin-x86_64.dylib
since .dylib is what System.mapLibraryName adds to library names. Also
updated compile.sh to produce .dylib on Darwin.

Removed LZ4 codes from the native codebase, they are already elsewhere
and don't belong here anymore.

refs #6675

Change-Id: I8dc95c5f91bc906c627b47e32ee1b9d1b6a4cb6d
Signed-off-by: Tuukka Lehtonen <tuukka.lehtonen@semantum.fi>

Merge branch 'master' of ssh://www.simantics.org:29418/simantics/platform

Merge commit '0e8cf1e'

Sync git svn branch with SVN repository r33184.

refs #6621
refs #6679
refs #6682

Merge "Re-implement URIStringUtils escape and unescape using Unicode"

Sync git svn branch with SVN repository r33176.

refs #6677

Sync git svn branch with SVN repository r33176.

refs #6677

Re-implement URIStringUtils escape and unescape using Unicode

Now escape only performs the absolute minimum amount of escaping
necessary. All String inputs are treated directly as UTF-16 characters
and only the smallest amount of 7-bit US-ASCII characters are escaped.
These characters are " ", "%", "#", "/" and "&". All other unicode chars
(> 127) are written directly as is into the escaped output.

The main effect of this change is that Simantics database URIs will
contain much less escaped characters than before. Since we always deal
with Java String (Unicode) character sequences in Simantics and these
URIs are only valid within Simantics, this approach doesn't really cause
any problems for us.

This implementation is not in accordance with RFC 2396 - Uniform
Resource Identifiers (URI): Generic Syntax but it works for us.

refs #6673

Change-Id: I5279f68993a087b856d58c36d63427562ea1d1e4

Fixed og.simantics.backup.ontology/build.properties

It contained an extra plugin.xml row which doesn't exist.

refs #6475

Added missing bundles to pom.xml.

Missing: org.simantics.acorn, org.simantics.backup{,.db,.ontology}.

refs #6475

Merge "Some Acorn improvements"

Include acorn db in db.client feature and make it the default db driver

refs #6596

Change-Id: I3be497696e5f0876387de5e6b5fb05144df2670b

Merge commit '15f7f51'

Sync git svn branch with SVN repository r33173.

refs #6475

Fixed org.antlr.runtime inclusion in dev.simupedia.com target definition

refs #6475

Change-Id: I9ce74f8d45fe464576c34616604adfb13c64aed7

Fix URIStringUtils.needsEscaping to escape chars outside 7-bit ASCII.

refs #6673

Change-Id: I445d800182d3ecb2d2d7248036fb3b8dfb102e81

Some Acorn improvements

1) Acorn: do not make snapshot if cancelCommit() is called

In some situations it is possible that when cancelCommit() is called
that acorn head.state writing writes nonsense due to
IllegalStateException being thrown from LRUObject.getStateKey()

2) Acorn: use a lock file to lock the current database

Use a lock file to prevent simultaneous usages of same database in Acorn

refs #6596

Change-Id: Ia33b90f85371c48154763f8a603cdce9a61d9ed6

Merge commit '4a2d762'

Sync git svn branch with SVN repository r33166.

refs #6475

Changed semantum target platform addresses to public ones.

refs #6475

Change-Id: Ib6d7513396c266a8aeda4898429b5f2d16c8f02a

Merge commit 'ad8333027322fda6b9a8a524c7a7e15a54c52f38'

Sync git svn branch with SVN repository r33158.

refs #6475

Merge "Reverted unintentional MANIFEST.MF change from c160c0a55f"

Reverted unintentional MANIFEST.MF change from c160c0a55f

refs #6666

Change-Id: I2c999479a2b0c1756fac6f2a1188e2b8fa5fcc4d

Merge commit '2ef2a5e5a52f8bfdbb5f2f47be2d3fbdcd2a8834'

Merge commit '25b6c25959c1fb3c60bb41cd0e1f0808e7fc3769'

Sync git svn branch with SVN repository r33154.

refs #6475

Sync git svn branch with SVN repository r33153.

refs #6475

SpreadsheetCells with Circular References support iterations.

Default number of iterations is 100 times.
Previously, AstIdentifier visits in CellValueVisitor would throw
IllegalStateException. Now, a FormulaError is returned instead.

refs #6659

Added some enforcement of immutability to structural user component UI's.

The changed UI components are:

* UC SCL Script/Module text editors
* UC interface editor

refs #6666

Several Wiki documentation view improvements.

* Pin Selection toggle button added to Documentation view toolbar
* Added support for linking to internal documents within the Simantics database in wiki documentation: [[Media:root://Documents/Document.pdf|This is the anchor text for the created link]]
** DocumentDialect will transform links like this into external links that look like this: [http://simantics-internal/http://Projects/Development%20Project/Project/Documents/Document.pdf This is the anchor text for the created link]
** Obviously external browsers and viewers do not understand these links but when these links are clicked in the Workbench Documentation view, the Browser component location changes are intercepted by the function returned by org.simantics.document.ui.function.All.locationChanging and the workbench's default action is performed for the database resource/variable that the URI in the link resolves to in the Simantics database.
* DiagramViewerSelectionProvider.SelectionElement will now return a the variable of the diagram composite when element selection is the diagram resource itself. This helps the Documentation view show the wiki page of the diagram composite when nothing is selected on the diagram editor.
* Fixed a couple of typos from org.simantics.scl.reflection.internal.registry.Namespace
* org.simantics.views.ontology now supports defining SWT RowLayout/RowData for modelled composites. This is used in the Documentation view to flow all the action buttons above the text editor to separate rows even when the view is not wide enough to fit all buttons on a single row.

refs #6449

Search-field in Help->Contents Fix.

Previously, searching in help contents caused NullPointerException when indexing.
Now, by setting extraDocuments to an empty array before indexing, NullPointer
doesn't occur and indexing proceeds as normal.

refs #6658

Included org.slf4j.api bundle in org.simantics.rcp feature.

The SLF4J API is required by the HDF5 Java interface library (JHI5) in Simantics based products.

refs #6621

Fixed master Simantics SDK target files.

refs #6475

Change-Id: Id93034d42367a3621256be2fc4d19688839eb49a

Merge "Testing SonarQube with Simantics Platform SDK - still"

Testing SonarQube with Simantics Platform SDK - still

Change-Id: I9aad52c8e9cbcf0606fb17f8c5af6bd5552ded68

Testing SonarQube with Simantics Platform SDK - still

Change-Id: Iaac29007287fa716a7e47e8756d98868e6be08c0

Merge "Testing SonarQube with Simantics Platform SDK - still"

Testing SonarQube with Simantics Platform SDK

Change-Id: I57fbb1de979f35f1c7e574e25bebee29c4da6b01

Merge "Testing SonarQube with Simantics Platform SDK"

Merge "Testing SonarQube with Simantics Platform SDK"

Testing SonarQube with Simantics Platform SDK

Change-Id: Id6e3e8f3cbef95cf140b9c1e8a4c40d9bfa0d185

Merge remote-tracking branch 'origin/svn' commit 'ccc1271c9d6657fb9dcf4cf3cb115fa0c8cb9589'.

Fetched r33145 from svn.

refs #6475

Merge remote-tracking branch 'origin/svn' commit 96bb7ef9cbe42d82eb58306

Change-Id: I71a8c4265d3db8b6bdce94bab7e6eafd543081f9

Sync git svn branch with SVN repository r33144.

refs #6475

Merge "Fixed acorn head.state writing"

Fixed acorn head.state writing

Write head.state to BinaryMemory first and then to file with correct
checksum

refs #6596

Change-Id: I8e8cc3765ef17ec7719a6d99e7fb97cafb17b448

Removed equations context from org.simantics.scl.runtime

Change-Id: I0c7c3a6d1abd4f9c7c4039e3e666d591b83c6f0c

Fixed typo from build.p2.site org.apache.lucene4.queryparser definition

Change-Id: I265c8bfdcae74b516a0d996e7f08b126b21c14df

Use Require-Bundle in lucene bundles to avoid class loading problems.

Change-Id: Ia5cb73cf8658fa245a79b7ac8ecc5a157b1d90a2

Changed base TP to use only local P2 repositories from www.simantics.org

Change-Id: I75943c43a70f926dee117cba6c3b74705e967b3d

Fix Export-Package definitions for org.eclipse.collections.

Change-Id: If12fbdc7f822c8481192e7b481596c81659be4fa

Bump org.apache.lucene4 bundle versions to 4.9.0.b0001.

Change-Id: If6440eb09d61abd09ac6c42c073c9c58dfa03926

Merge "org.apache.lucene4 bundles now define import-packages with version 4.9.0"

org.apache.lucene4 bundles now define import-packages with version 4.9.0

Change-Id: Ia36c64fa84c656083a5764d198679e6b2e86df19

Added org.jfree.feature module to features/pom.xml.

Removed unwanted Import-Package from pom.xml for now.

Fixed version to 2.1.7.b1 and reversioned in .target file also.

Change-Id: Ib2bccf450927c6b94dfa423f95de303f249f0572

Reversion com.lowagie.text to 2.7.1.b1 to prevent cached loading.

This problem hit Hannu hardest because he had used oomph which caused
all workspaces on his system to share loaded artifacts. This meant his
machine never fetched the new version of this plug-in but kept using the
old SVN version.

Change-Id: Ib2bccf450927c6b94dfa423f95de303f249f0571

Merge "Replace embedded pdfbox jars with external plug-ins."

Sharing org.simantics.acorn for everyone to use

Change-Id: I3e110dd01c31dd0e0885887cfa66e42c3849bc2e

Replace embedded pdfbox jars with external plug-ins.

Also updated pdfbox version from 1.8.10 to 2.0.2.

Change-Id: I400d049f5d90f839b9075e4370bd565b642d756a

Added org.apache.pdfbox.xmpbox to external components.

Also removed unused dependency on org.bouncycastle from
org.simantics.help.base.

Change-Id: I65cb95d466aa6295cae59df4d7c6450878cdafe8

Add .keep files to ensure src exists in org.simantics.desktop bundles.

Change-Id: I7a26e0badf5aefa6fb21132d19ede13d0be80c3d

Merge remote-tracking branch 'origin/svn'

Change-Id: Ib64bce0e85c78300c078f16a948d9db2f4872ed5

added org.jfree.feature from svn

added backup.db and backup.ontology plugins

Merge remote-tracking branch 'origin/svn'

Change-Id: I59e937dd070a311f4d80579bbdfdc4589a16889a

added org.apache.batik from svn

Merge remote-tracking branch 'origin/svn'

Change-Id: Iacf80b151f71a6fcfa294fe48d3ed57e6ce72b10

merged svn revision 33114 and added desktop and help plugins

Added equations to exported packages

Change-Id: I2a5edd3bf365311fce063e155379835cb05788b7

Merged svn branch

Change-Id: Ia5151ea9c804ac3af3621ba472dfd91978945161

added org.simantics.backup

Merge "Bundle com.sun.jna and com.sun.jna.platform version 4.2.2 as plug-ins."

Merge remote-tracking branch 'origin/svn'

Change-Id: I478743179fe637965255b3ed1d7d03c0fc0c54ab

Bundle com.sun.jna and com.sun.jna.platform version 4.2.2 as plug-ins.

Change-Id: Ie90169f5f9eff03069a7e4802a5cd3527d9d2b62

migrated to svn revision 33108

Regenerated graph.tg.

Change-Id: Ie866960a0fc64bd85d6802f8aa85467101cc0948

Added org.simantics.editors.win32 to bundles.

Merge branch 'master' of ssh://www.simantics.org:29417/simantics/platform

Enabled tycho plugin and feature source builds.

Enabled tycho plugin and feature source builds.

Feature and bundle changes required to build with Tycho

Apache POI ExtendedColor API has changed from 3.10 to 3.14.
ExtendedColor.getRgbWithTint is now inherited from Color which has method getRGBWithTint.

Tycho compilation changes for SVN version also.

Fixes to allow tycho builds to work.

Added missing parts from SVN org.simantics.root project.

Migrated source code from Simantics SVN

Initial empty repository