Add .gitkeep files to ontology plugins src-folders

refs #7317

Change-Id: Iad353904a36c1832837feb0b0f235e87962bd9d1

More meaningful debug printing to PrettyPrintTG

Also removing commented out code

refs #7276

Change-Id: I1aee2b8424444a7ee0b3a08be31dbc3375b3e21f

Merge "(refs #7316) Improved error locations for invalid field access"

(refs #7316) Improved error locations for invalid field access

Change-Id: Ie901cd59e0cf45ece1c99932d44ac1863da97565

Fixes to SCLLabelRule definitions

refs #7315

Change-Id: I9e1ae08ab39a440c60e5abf3d37edfeb4419e96f

Fixed diagram profile monitor DnD regression.

CTRL+dragging diagram profile monitor values from diagram to Model
Browser chart/subscription nodes now works again. The code now processes
also dragged data that contains an RVI in String format.

refs #7313

Change-Id: I0154414df73ea96c29a8e5aa44881781f5d62675
(cherry picked from commit b9d4701787a7aba852ec02aaef6149b8203344b3)

DocumentRequest performance enhancements (Simupedia)

refs #7303

Change-Id: I719ac5a0c0c1dc02850d5ed140e7234ae280cdf6

Merge "Revert "Default property editing restores assertions""

Revert "Default property editing restores assertions"

This reverts commit c4c152bf639475b85efad1e8bd6ea007c08a9e1f.

Reason: If user has set the value of a property to X, he expects it to stay as X until all eternity instead of the value changing when the assertions in the ontology change.

refs #7302

Change-Id: I5cd33d17413b118f522456b37b27df757f42861b

Merge "Default property editing restores assertions"

Fixing exclude filter bug & adding query cache flushing

refs #7305

Change-Id: I16b48b8d0aa4cb19a1cbc60084d046ec83d20187

Fixing PrettyPrintTG to not concatenate strings in logging

However, creates unnecessary Object[] now..

refs #7276

Change-Id: Icc78a9c39f147f52f5b75ed5b7fcedf200293ea8

Merge "(refs #7307) Added features field to SCL module header"

(refs #7307) Added features field to SCL module header

SCL language features are now enabled in the module header with syntax
module { features = [chr, fields] }
instead of
module { chr, fields }

Change-Id: Ibc533bc246efb29313e66576988913b09839b380

TransferableGraphUtils.getObjects2 for fixing not-found handling

refs #7306

Change-Id: I1d8dfefb51d579b1cb5ca9e15df82c0a8e347619

Lots of fixes for PrettyPrintTG

* Ordering predicates alphanumerically for deterministic ordering
between two databases
* Filtering L0.identifier statements
* Hash-based naming for blanks for ordering output print

Still needs some optimiziations to improve performance lost with these
changes..

refs #7276

Change-Id: I6848b319094863a8c85e4deca91df721b1642ce7

Add inclusion filter to modelled STS tests

refs #7305

Change-Id: Iad8b19ceddaad0c493a2b8a8b5d267ab0abb0a8a

Some minor fixes for pretty printing TG

#7276

Change-Id: I838c99e0151c68e8efc9c54189cc1c94e26f55c2

Default property editing restores assertions

refs #7302

Change-Id: I6e3b189cae025bcea85ae1265b4c80ade2dc9d16

Merge "(refs #7298) Automatic refresh to SCL Console"

(refs #7298) Automatic refresh to SCL Console

Change-Id: I2799a6d1afa3d3e4724c55dda81ef88cc06b975e

Improved PDF diagram export wizard user experience

* Page number addition is now an option in the wizard page
* The diagram selection tree no longer automatically expands itself
  fully when any node is (un)checked. Automatic expansion is only done
  up to the second node level only.
* The diagram filter now works with a 500ms quiet time delay which means
  writing in the filter shouldn't slow down the UI like it used to.
* Initial selection is more properly taken into account when
  initializing the wizard page. The containing model/index root is
  always sought based on the selection and the diagrams contained by the
  selected resource are then initially selected for that model in the
  diagram list.
* The Select/Deselect Visible buttons have been removed and Expand and
  Collapse buttons have been added instead for expanding and collapsing
  the selected tree nodes.
* The Select All and Deselect All buttons now work differently. If any
  filter is applied to the current tree view, only the diagrams shown in
  the tree are selected/deselected when either button is pressed. If no
  filter is applied, all diagrams will be selected/deselected.

refs #7297

Change-Id: I078a80528ba91c337f9921422d08a75c95cad45f

Added URIUtil.encodeFilename2 which encodes only necessary characters.

The new method uses the same '%' URI style encoding as
URIUtil.encodeFilename but encodes only characters that cannot be
present in Windows file names, i.e. the following: <>:"/\|?*

This method can be used to convert arbitrary user-given names to valid
file names in wizards etc.

refs #7301

Change-Id: Ia7e264e5304ff0533376c73f5ae9312e197ccf15

Use proper URI encoding/decoding in fail-safe import

Earlier implementation didn't handle correctly cases where missing
resources had slashes in their names. Also fixed error reporting logic
to not remove error messages from sibling resources with matching
prefix.

refs #7300
Change-Id: Ia3ff0b09e592ff63fbb2872fa9329c3a471ed382

Fixed URI of the root resource in fail-safe import

URIStringUtils.splitURI returns root URI in non-standard format, so fix
it manually as a workaround. Otherwise ExternalEntities cannot be
created under the root resource.

refs #7299
Change-Id: Ie548eebba5c267617cb845df684b025b59c069f5

(refs #7296) Improvements to SCL module tree

Separate folder for StandardLibrary. Handling of module names starting
with http://.

Change-Id: I695e6ca75a06b636c33e63cab259334ea989a429

Fix stackoverflow from excel import

refs #7295

Change-Id: I4a6815fa42ccd4d337f37ff0f527e0d46a129598

Editor for modelled STS variables for easier debugging

refs #7294

Change-Id: Ie100c751bf2e6e1cf8b173dd02de724959aadcc3

Merge "Enhancements to modelled tests"

Merge "(refs #7284) Fixed SCLAnnotationModel to cope invalid error ranges"

Take Tycho 1.0.0 into use.

Set useProjectSettings=false to keep backwards compliant.

refs #7288

Change-Id: I3b1735cb27676baae89549a4e4281e6003f5bbf7

Updated external dependencies and p2-maven-plugin

* eclipse collections 7.1.0 to 8.1.0
* fastutil 7.0.13 to 7.2.1
* removed gnu.trove 2.1.0

refs #7285

Minor wording update to release engineering instructions.

refs #7263

Change-Id: I8cc31482fb4db482aa76e4798623f62e4948655f

(refs #7284) Fixed SCLAnnotationModel to cope invalid error ranges

Change-Id: I346088d720595a213445c8cb988de442cfb90863

Enhancements to modelled tests

* Added an assertion for long strings
* Unique test descriptions even though they are similarly named
* equals and hashCode for ModelledSTSTest

refs #7277

Change-Id: I25bb7a96291050a81e9346e78306a67666b87877

(refs #7278, refs #7279) Small fixes to InternalCompilerExceptions

Change-Id: I771fb27ecc98a7cd4f05aaf5e23a4763a6a0ca52

E4WorkbenchUtils.getMPartById to create the part if not already created

refs #7275

Change-Id: Iff469ad0586c8ad16f411ab232ffc5a47825ef72

Merge "Do not merge TG if it is not set as immutable"

Fixing NPE with modelled tests

refs #7277

Change-Id: Ie3dc4c982fe01e469a0e302f3ace0e5f484737f6

Do not merge TG if it is not set as immutable

refs #7274

Change-Id: I8a13dc2b0bb0cc3cc98c5f661da8b46dae7e0455

Merge "Resolve some dependency problems with SDK features"

Resolve some dependency problems with SDK features

* org.simantics.db.client.feature should include necessary compression
plugins in order to work

refs #7273

Change-Id: I73085731826803cb6e49884384a709dab309baeb

Enhancements to modelled tests

* Single test has now an isolated and own SCL CommandSession
* Tests can depend on one another and the SCL variables are available
for the depenent tests
* Added support for declaring SCL variables under the test definition
(suitable e.g. for large literals for comparison)

refs #7277

Change-Id: I5089bca479f681b42ee955851ab50ce24a3158a3

Make prettyPrintTG available via SCL from Simantics/DB-module

refs #7276

Change-Id: I640f4cb6d929482577ed8874e6b8fadcaa05ba64

(refs #7250) Merged feature/modularCHR to master.

Change-Id: Icad6e8c9594826f70d929792f7d258c5514d0550

(refs #7250) Support for record syntax for CHR relations

Change-Id: I8dd80eb5216a1b6023ab9097af58d4f1aaa077b2

Merge "(refs #7272) Support updating named Graphviz windows"

(refs #7272) Support updating named Graphviz windows

Change-Id: I72080ec1cba333cf9639a9801814e5fc100a8309

Merge "Optionally print also into IDE console"

(refs #7250) Error messages for undefined existentials

Change-Id: Iaddc3d0536350eef85086b0a73a5c1b08055398c

(refs #7250) CHR bugfixes, cleaning up unit tests

Change-Id: If0f255ce74938029ab91975a2db7a09c517473aa

(refs #7250) Merging master, minor CHR bugfixes

Change-Id: I11c76beee0e73ff78370f72bbfb88fdbdf6c7616

Merge "Improved Statement API in Simantics/DB"

Merge "(refs #7264) Better updating of SCL module tree"

(refs #7250) CHR rules modularization (first working version)

This change adds a complete implementation of CHR modularization. New
top level declaration ruleset allows to define rulesets that can be
included into other rulesets (see CHR{5,6}.scl).

Change-Id: I3a188d788602fa27f863e16969f956d79c9684a9

Optionally print also into IDE console

refs #7226

Change-Id: I52c900d8b495cb68eed028cc219dd56965447e7c

Improved Statement API in Simantics/DB

refs #7270

Change-Id: I3780a424247bea8eaeeaa204595625844f3b0883

Merge "Removed print"

Removed print

refs #7173

Change-Id: Ie6d163943cafebbbde14253590d6298525327b03

(refs #7264) Better updating of SCL module tree

Change-Id: I0f8c7f1314335b301bcfe84422d9e5eb4df36593

Updated release engineering documentation.

refs #7263

Bumped master target and org.simantics.sdk feature versions to 1.30.0.

refs #7263

Merge "(refs #7260) Added a new DerivedProperty to SCLValues"

Merge "(refs #7259) Added Iterator.filter and MSet.filterInPlace"

(refs #7260) Added a new DerivedProperty to SCLValues

DerivedProperty prevents certain optimizations applied for private
values. This is needed because mechanisms deriving values are assuming
that certain Java methods will be generated.

Change-Id: I1ca9d839b6a4a4c9faa63e5faaa832e49f2d76d8

Merge "Moved passing tests from UnimplementedTests to ModuleRegressionTests"

(refs #7259) Added Iterator.filter and MSet.filterInPlace

Change-Id: If8d9ff797a2747346e42e3242da292dc78784e9b

sclChildRule template for defining child rules with SCL code

refs #7258

Change-Id: Id6a898d5d194ab909101add4babe9ee5bc0ae463

(refs #7250) Added new grammar rules for modular CHR rules

Change-Id: I55851a496fda5b1bc135a17d37f28770b36f5007

Fixes to variable implementations

refs #7251

Change-Id: I955e563f7b78496968305fe5b3bdc23255194db8

Moved passing tests from UnimplementedTests to ModuleRegressionTests

Change-Id: Id5e2c8c18c73147e7f1c30bb7cb8fcb56dcb6e76

ResourceCollectionVariableMap for defining custom variable spaces in SCL

refs #7257

Change-Id: Ia523efed9fbcb9248e65938c790b347e6ad3a41a

(refs #7250) Refactoring CHR implementation

This change is preparation for the modularization of the CHR rule
systems. The main change is moving the major rule execution code from
fact classes to priority level classes.

Change-Id: Idd63339d8c2cf81e2af07660f0f81cae273c1d62

Diagram to SVG enhancements

refs #7253

Change-Id: I155f57928428f8ec4c39ffad90558396547dc10f

Merge "Fixes to variable implementations"

Fixes to variable implementations

refs #7251

Change-Id: Ideebcc4caca35339544554c287cccb2107caced3

Merge "(refs #7250) Cleaning up CHR code generation"

OpenDefaultEditor should not cache adapters that cannot be opened

#7252

Change-Id: Idf1a4e15fd808c540934dbfc6bc75d5b72016a1b

(refs #7250) Cleaning up CHR code generation

Change-Id: Iad454f1f7cdc0f27e21a2db03680312f49ab1059

Merge "(refs #7245) The first version of decompiler for SCL compilations"

Merge "Added Simantics/Diagram function positionToVector."

Added Simantics/Diagram function positionToVector.

This function complements the existing positionToDoubleArray and is
required to support for instance diagram template scenegraph node
transform property definition with SCL formulas.

Also fixes:
* Potential NPE in ExperimentUtil.scheduleShutdownActiveExperiment
* MANIFEST.MF warnings from org.simantics.document.server

refs #7246

Change-Id: Icfe41a33824c91e5be76940bbf4d46d34c8d0334

Support for dynamic transforms for both elements and terminals

Includes also minor code warning/logging cleanup.

refs #7119

Change-Id: I2df8f0f0707e8adf1569679ab41a74f605ae1268

(refs #7245) The first version of decompiler for SCL compilations

It is intentional that the new fragment
org.simantics.scl.compiler.decompiler is not added to the module
listings in bundles/pom.xml, because currently this feature is intended
only for development purposes.

Change-Id: Iff184f783c1a924ff00823486b4c13aa957ca184

(refs #7242) Fixed NPE in SCLModuleTree

A null input must be handled when the component is disposed.

Change-Id: I915c68aa3d15b4d5a3cbd89220bd3701f262fee1

Added procyon decompiler to target platform

Change-Id: I0bfad66709f89c3c27f16311d3adde69b80afda2

(refs #6923) Explicit export annotation for SCL modules

Added module export list to module header. It looks like this:

module {
    export = [foo, bar]
}

When using export list, @private annotation is not supported anymore.
All symbols not exported are effectively private.

Change-Id: I7827f6cf6062388ddd06be0ab401409bd08464fe

Jersey HTTP Client - increase .target's sequenceNumber just in case

#7243

Change-Id: I455326fbad7adfff04fa0a23a50ab689d3091e7b

Merge "Add missing jersey-server for Jersey HTTP Client.. does not make sense.."

Add missing jersey-server for Jersey HTTP Client.. does not make sense..

#7243

Change-Id: I378c43b1d9f72dc98b9f23d790c544238fe177f3

Merge "(refs #7242) Refresh button to SCL Module browser"

Merge "Jersey HTTP Client - Remove (hopefully) unnecessary dependencies.."

Jersey HTTP Client - Remove (hopefully) unnecessary dependencies..

Change-Id: I7e532295639158da7f0971cd75252a0068406b3e

Merge "Jersey HTTP Client - Why "-" is not good enough for versioning?"

Jersey HTTP Client - Why "-" is not good enough for versioning?

#7243

Change-Id: I98952ab61b6e4ef1a37795bab2a530772a2761ae

Jersey HTTP Client - Oh my ruis, yet another version mismatch

#7243

Change-Id: I0be124f994a3ed777c48792a68de59e489a3c3c8

Jersey HTTP Client - Ok now I get how this works

#7243

Change-Id: I69fa5d738663f0dee462a41841097bc70f9f7e6e

Jersey HTTP Client - Still going strong

#7243

Change-Id: Ied41cc202f0efb01aefacd737b673e47eb209960

Jersey HTTP Client - almost finished :)

#7243

Change-Id: Ie7f79a9980ddb2e8c9d60dfb76f670a30267f400

Jersey HTTP Client - Wrong version numbers..

#7243

Change-Id: Id0af2b5d4caae2dfc12d87b2b2d5d94b5cc4df5c